See download stats for:    Bioconductor software packages    Bioconductor annotation packages    Bioconductor workflow packages

Download stats for Bioconductor experiment packages

This page was generated on 2024-09-05 05:24:22 -0400 (Thu, 05 Sep 2024).

The number reported next to each package name is the download score, that is, the average number of distinct IPs that “hit” the package each month for the last 12 months (not counting the current month).


Top 15

1TCGAbiolinksGUI.data (3544)
2celldex (3485)
3ALL (3418)
4HSMMSingleCell (2870)
5airway (1921)
6geneLenDataBase (1754)
7scRNAseq (1735)
8pasilla (996)
9sesameData (943)
10tximportData (815)
11GSVAdata (750)
12TENxPBMCData (713)
13depmap (711)
14ChAMPdata (691)
15msigdb (623)

All experiment packages

All experiment package stats in one file: experiment_pkg_stats.tab

All experiment package download scores in one file: experiment_pkg_scores.tab

See Download stats for Bioconductor experiment repository (all packages combined)

4

4.10.1 (1)

A

a4Core (0)
a4Reporting (0)
aads.rnai (1)
ABAData (10)
abc (1)
abc.data (1)
abind (2)
ace.fma (1)
acepack (3)
ACTIONet (1)
ActivePathways (1)
actuar (1)
ada (1)
adabag (1)
AdaptGauss (1)
addinslist (1)
adductData (80)
ade4 (5)
adegenet (1)
adegraphics (1)
adehabitat (1)
adephylo (1)
ADGofTest (1)
aditools (1)
adjustedCurves (1)
admiral (2)
admiral.test (1)
admiraldev (1)
admisc (15)
ADMM (1)
adSplit (1)
AER (1)
afex (2)
affxparser (1)
affy (1)
affycompData (69)
affycoretools (1)
affydata (435)
Affyhgu133A2Expr (46)
Affyhgu133aExpr (86)
Affyhgu133Plus2Expr (71)
affyio (1)
AffymetrixDataTestFiles (84)
Affymoe4302Expr (52)
Affymoe430Expr (1)
affyPLM (1)
AGHmatrix (0)
AgiMicroRna (0)
agricolae (9)
agridat (1)
agrmt (1)
AICcmodavg (1)
aigoraFitMini (1)
AIMS (0)
AIPW (1)
airr (1)
airway (1921)
akima (1)
alabama (1)
alakazam (1)
ald (0)
ALDEx2 (1)
aldvmm (1)
alembic (0)
AlgDesign (3)
alkahest.generic (0)
ALL (3418)
all (1)
allenpvc (3)
ALLMLL (154)
alluvial (1)
almanac (0)
alphahull (1)
alphashape3d (1)
alphavantager (1)
alpineData (12)
alr3 (1)
alr4 (1)
altair (1)
amap (1)
AMARETTO (0)
ambient (1)
Amelia (1)
AmesHousing (1)
amgen.okta.client (1)
amgsafetyvis (1)
amlogger (1)
AmpAffyExample (51)
ANCOMBC (1)
AneuFinderData (106)
angrycell (1)
animation (2)
annaffy (1)
anndata (1)
AnnoProbe (1)
annotate (2)
AnnotationDbi (23)
AnnotationFilter (1)
AnnotationForge (1)
AnnotationHub (3)
AnnotationHubData (1)
annotatr (1)
anRichment (0)
anticlust (1)
antiProfilesData (75)
AnVIL (0)
anytime (6)
aod (2)
apcluster (1)
APCtools (1)
ape (50)
apeglm (1)
apex (1)
apexcharter (1)
APL (1)
apLCMS (1)
aplot (58)
appgen (1)
aqp (1)
aracne.networks (55)
archive (2)
ArchR (0)
argparse (13)
argparser (1)
argus.DS.Credentials (3)
argusDS.apc.utils (3)
argusDS.backtesting.engine (3)
argusDS.data (3)
argusDS.data.engineering (1)
argusDS.data.preparation (2)
argusDS.data.preparation2 (4)
argusDS.data.visualisation (1)
argusDS.database (2)
argusDS.DataValidation (1)
argusDS.DB.manager.utilities (2)
argusDS.distributions (1)
argusDS.driver.importance (3)
argusDS.FCUtilities (2)
argusDS.FZ.SourceData (1)
argusDS.FZ.utils (1)
argusDS.gamboostLSS (1)
argusDS.gamlss.distributions (1)
argusDS.gamlss.forecast (3)
argusDS.gamlss.modelling (3)
argusDS.gamlss.smoothers (1)
argusDS.gamlss.testing (3)
argusDS.gamlss.utils (2)
argusDS.GlobalSettings (1)
argusDS.model.testing (1)
argusDS.model.tools (3)
argusDS.model.validation (1)
argusDS.modeldb (1)
argusDS.possibility.curves.daily (1)
argusDS.PossibilityCurves.db.utils (2)
argusDS.PossibilityCurves.utils (1)
argusDS.S3 (1)
argusDS.shiny.utils (2)
argusDS.signal.dataprep (1)
argusDS.smoothers (1)
argusDS.spread.trading.utils (3)
argusDS.Studio.APC (1)
argusDS.Studio.FC (1)
argusDS.studio.ml (1)
argusDS.studio.model.utils (1)
argusDS.Studio.MyStudio (2)
argusDS.Studio.permissions (2)
argusDS.Studio.utils (3)
argusDS.tabulator (2)
argusDS.trading.optimization (1)
argusDS.trading.performance (2)
argusDS.TradingSignals (1)
argusDS.UI (2)
argusDS.utilities (1)
aricode (1)
arm (4)
aroma.affymetrix (8)
aroma.apd (9)
aroma.core (9)
aroma.light (1)
ArrayExpress (1)
arrayhelpers (1)
arrayop (1)
arrayQualityMetrics (0)
ARRmData (96)
arrow (23)
arsenal (2)
arules (4)
ArvadosR (1)
arvupload (1)
ascii (1)
asciicast (1)
ASExtras4 (0)
AsgntDAMacro (1)
ash (6)
AshkenazimSonChr21 (25)
ashr (2)
asht (1)
ASICSdata (46)
AsioHeaders (6)
askpass (198)
ASMap (1)
asremlPlus (1)
assert (1)
assertive (1)
assertive.base (1)
assertive.code (1)
assertive.data (1)
assertive.data.uk (1)
assertive.data.us (1)
assertive.datetimes (1)
assertive.files (1)
assertive.matrices (1)
assertive.models (1)
assertive.numbers (1)
assertive.properties (11)
assertive.reflection (1)
assertive.sets (1)
assertive.strings (1)
assertive.types (12)
assertr (3)
assertthat (2)
AssessORFData (90)
ASSET (0)
AssotesteR (0)
astsa (1)
ATACseqQC (1)
ATE (1)
ATR (1)
attachment (4)
attempt (1)
AUC (1)
AUCell (1)
audio (2)
audited (1)
auth0 (1)
av (1)
ava2 (2)
aws (1)
aws.ec2metadata (1)
aws.s3 (6)
aws.signature (6)
awsMethods (1)
azcore (1)
Azimuth (1)
AzureAuth (2)
AzureGraph (5)
AzureRMR (6)
AzureStor (1)

B

b64 (1)
babelgene (6)
babelmixr2 (1)
babelwhale (0)
babynames (1)
backbone (0)
backports (101)
BADER (0)
badger (0)
badminton (1)
baguette (1)
bain (1)
BalancedSampling (0)
ballgown (0)
bambu (0)
BART (1)
bartMachine (1)
bartMachineJARs (1)
base2grob (1)
base64 (4)
base64enc (2)
base64url (1)
basefun (1)
basemaps (1)
BASiCS (1)
basilisk (1)
basilisk.utils (1)
batchelor (1)
BatchJobs (1)
batchtools (1)
battenberg (1)
BayesFactor (2)
BayesFM (1)
bayesm (9)
bayesmeta (1)
bayesplot (13)
BayesPostEst (1)
bayesQR (1)
bayestestR (9)
BayesX (1)
baySeq (5)
BB (1)
BBmisc (1)
bbmle (14)
bbotk (1)
bbr (1)
bbr.bayes (1)
bccaEndometrial (1)
bcellViper (608)
bcp (1)
BDAtemplates (1)
bdsmatrix (14)
BE (1)
beachmat (2)
beadarray (1)
beadarrayExampleData (202)
BeadArrayUseCases (43)
BeadDataPackR (0)
BeadSorted.Saliva.EPIC (74)
beanplot (1)
beaver (1)
beepr (1)
beeswarm (1)
bench (1)
benchmarkfdrData2019 (25)
benchmarkme (1)
benchmarkmeData (1)
benchr (1)
BentoBoxData (0)
berryFunctions (1)
Bessel (1)
bestglm (1)
bestNormalize (2)
beta7 (36)
betareg (1)
bettermc (1)
bezier (1)
BFpack (1)
BgeeDB (1)
BGLR (1)
bgs.hephaistos (1)
bgs.hermes (1)
BH (223)
BIApylon (1)
BiasedUrn (14)
BIAutils (1)
bib2df (1)
bibtex (2)
biclust (0)
BIEN (1)
bife (1)
biganalytics (0)
bigassertr (1)
bigD (1)
bigdist (0)
BIGL (1)
biglasso (1)
biglm (2)
biglmm (1)
bigmemory (2)
bigmemory.sri (2)
bigparallelr (1)
bigreadr (1)
bigrquery (15)
bigsnpr (0)
bigsparser (1)
bigstatsr (1)
bigutils (0)
bigutilsr (1)
billboarder (10)
binb (1)
bindr (1)
bindrcpp (1)
binGroup (1)
binman (2)
binom (1)
binr (0)
bio3d (4)
biobank (1)
Biobase (9)
BioBase (1)
bioc::GenomeInfoDbData (0)
BiocBaseUtils (1)
BiocCheck (1)
BiocFileCache (5)
BiocFileCaches (1)
BiocGenerics (24)
BiocInstaller (1)
BiocIO (2)
BiocManager (290)
BiocNeighbors (3)
Bioconductor (1)
BiocParallel (19)
BiocSingular (2)
BiocStyle (1)
BiocVersion (28)
biocViews (1)
BiodiversityR (1)
BioEnricher (1)
Biogenerics (1)
BioGenerics (1)
BioImageDbs (24)
BioInstaller (1)
biomaRt (2)
biomartr (1)
biomformat (1)
biomod2 (1)
BioNet (1)
BioPlex (29)
biostat3 (1)
biostatR (0)
biostatUtil (0)
Biostring (1)
Biostrings (17)
biotmleData (54)
biotools (1)
BioVersion (1)
biovizBase (1)
BiplotML (1)
BiRewire (0)
birta (0)
biscuiteerData (91)
bit (57)
bit64 (12)
bitops (40)
bizdays (2)
bkbutils (1)
bladderbatch (534)
BlakerCI (1)
blastula (1)
blavaan (1)
blimaTestingData (43)
blme (7)
blob (80)
blockcluster (1)
blockCV (1)
blockForest (1)
blockmodeling (1)
blogdown (0)
BloodCancerMultiOmics2017 (56)
bluster (1)
BlythStillCasellaCI (1)
BMA (1)
BMisc (1)
bmp (1)
bmspal (1)
bnlearn (2)
bodymapRat (150)
BOIN (1)
bold (1)
bookdown (42)
Boom (1)
boomer (1)
BoomSpikeSlab (1)
boot (75)
bootstrap (1)
botor (0)
box (11)
box.linters (1)
BPCells (1)
bpcp (1)
bRacatus (1)
BradleyTerry2 (1)
brainImageRdata (4)
brave (1)
breakpointRdata (128)
breastCancerMAINZ (102)
breastCancerMKI (0)
breastCancerNKI (99)
breastCancerTRANSBIG (93)
breastCancerUNT (79)
breastCancerUPP (111)
breastCancerVDX (179)
brew (70)
brgedata (89)
brglm (1)
brglm2 (1)
bricks (0)
brickster (0)
BridgeDbR (1)
bridgesampling (1)
brio (148)
brms (1)
brmsmargins (1)
Brobdingnag (1)
broman (1)
bronchialIL13 (39)
broom (115)
broom.helpers (11)
broom.mixed (1)
broomExtra (1)
BrowserViz (1)
bs4Dash (13)
BSgenome (3)
BSgenome.Drerio.UCSC.danRer11 (1)
BSgenome.Ggallus.ENSEMBL.galGal6 (0)
BSgenome.Hsapiens.1000genomes.hs37d5 (1)
BSgenome.Hsapiens.NCBI.GRCh38 (0)
BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19 (1)
BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg38 (3)
BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg38.dbSNP151.major (1)
BSgenome.Mmul10.SIVmac251 (1)
BSgenome.Mmulatta.NCBI.mmul10.tmp (0)
BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm10 (1)
BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm39 (0)
BSgenome.Oaries.ENSEMBL.RambV2 (1)
BSgenome.Omela.CUSTOM.oenMel1.1 (0)
BSgenomes (1)
bsicons (3)
bslib (367)
bsplus (1)
bsseq (1)
bsseqData (114)
bsts (1)
btergm (1)
bumphunter (1)
bupaR (1)
butcher (3)
bvls (1)
BWStest (2)

C

C50 (1)
ca (5)
CAbiNet (1)
cache (1)
cachem (264)
cAIC4 (1)
Cairo (19)
calibrate (1)
callr (237)
callthat (0)
CAM (1)
CAMERA (1)
campsis (1)
campsismod (1)
cancerdata (99)
candisc (1)
canvasXpress (1)
caper (1)
capsidr (1)
captioner (1)
capushe (1)
car (33)
carData (3)
Cardinal (1)
CardinalWorkflows (85)
caret (27)
caretEnsemble (8)
carrier (1)
CARTools (1)
casebase (1)
castor (2)
CATALYST (1)
catboost (1)
catdata (1)
Category (1)
caTools (6)
CATT (0)
causaldata (1)
CausalGPS (1)
cba (1)
CBDD (1)
CBPS (1)
ccaPP (1)
ccdata (120)
ccdrAlgorithm (1)
ccDSM (1)
CCl4 (80)
ccTutorial (39)
cdip.datastore (1)
celarefData (28)
celda (1)
celldex (3485)
CellMapperData (40)
cellpypes (1)
cellranger (1)
cellxgene.census (1)
cem (1)
censored (1)
censReg (1)
CeTF (0)
ceu1kg (13)
ceu1kgv (11)
ceuhm3 (13)
cfToolsData (69)
cgam (1)
cgdsr (0)
cgdv17 (14)
CGHbase (1)
CGHcall (1)
cghMCR (0)
ChAMP (1)
ChAMPdata (691)
champdata (0)
changepoint (1)
chanmetab (1)
charmData (12)
checkmate (225)
checkr (1)
ChemmineOB (0)
ChemmineR (1)
chemometrics (1)
cheung2010 (13)
chevron (1)
ChIC.data (18)
chimera (0)
chimeraviz (0)
ChimpHumanBrainData (28)
ChIPComp (0)
chipenrich (0)
chipenrich.data (175)
ChIPexoQualExample (56)
ChIPpeakAnno (1)
ChIPQC (1)
ChIPseeker (1)
chipseq (0)
chipseqDBData (40)
ChIPseqR (0)
ChIPsim (0)
ChIPXpressData (121)
chk (6)
chopsticks (0)
choroplethr (1)
chroGPS (0)
chromDraw (0)
ChromHeatMap (0)
chromote (9)
chromstaRData (110)
chromVAR (1)
chron (4)
cicero (1)
circlesize (0)
circlize (52)
cisPath (0)
CiteFuse (0)
citril (1)
Ckmeans.1d.dp (0)
clarabel (1)
class (52)
ClassDiscovery (1)
classInt (37)
cleanrmd (1)
cleanUpdTSeq (0)
cleaver (0)
cli (332)
CLIFF (1)
clinfun (1)
ClinicalQc (0)
clinPK (0)
ClinViz (1)
clippda (0)
clipper (0)
clipr (22)
cliqueMS (1)
clisymbols (1)
CLL (225)
CLLmethylation (24)
clock (17)
Clomial (0)
Clonality (0)
clonotypeR (0)
clst (0)
clstutils (0)
clubSandwich (1)
clue (56)
CluMSIDdata (50)
cluster (89)
clusterCrit (1)
clusterGeneration (4)
clustermq (5)
clusterprofielr (0)
clusterProfiler (4)
ClusterProfiler (1)
ClusterR (1)
clusterSim (1)
clusterStab (0)
ClusterTools (1)
clusthaplo (0)
clustifyrdatahub (38)
clustMixType (1)
ClustOfVar (1)
clustree (2)
clv (1)
clValid (1)
CMA (0)
cMap2data (173)
cmapR (1)
CMAverse (1)
cmdstanr (1)
CMplot (0)
cmprsk (4)
CmsAnalytics (1)
cn.farms (0)
cn.mops (1)
CNAnorm (0)
CNEr (1)
CNORdt (0)
CNORfeeder (0)
CNORfuzzy (0)
CNORode (0)
CNPBayes (0)
CNTools (0)
cnvGSA (0)
cnvGSAdata (41)
cnvgsadata (0)
CNVPanelizer (0)
CNVrd2 (0)
CNVtools (0)
coastr (1)
cobalt (2)
cobindR (0)
cobs (1)
CoCiteStats (0)
coda (23)
coda.base (1)
codelink (0)
codetools (83)
CODEX (0)
CoGAPS (0)
cogena (0)
cogeqc (1)
coGPS (0)
COHCAP (0)
COHCAPanno (76)
coin (2)
collapse (1)
collections (1)
coloc (20)
colonCA (56)
colorfulVennPlot (1)
colorRamps (12)
colorspace (86)
colortools (1)
coloRz (1)
colourpicker (11)
colourvalues (1)
cols4all (1)
ComBatFamQC (1)
combinat (1)
coMET (0)
commentr (1)
common (1)
CommonJavaJars (1)
commonmark (224)
compareDF (1)
compareGroups (1)
COMPASS (0)
compcodeR (0)
CompGO (0)
ComplexHeatmap (15)
complexheatmap (0)
ComplexUpset (1)
compositions (3)
CompQuadForm (1)
compute.es (1)
concaveman (1)
concrete (1)
condiments (1)
conditionz (1)
condMVNorm (1)
coneproj (1)
conf.design (1)
CONFESSdata (44)
config (30)
configr (1)
confintr (1)
conflicted (14)
confoundr (1)
connectapi (1)
ConnectivityMap (50)
connectwidgets (1)
conquer (3)
ConsensusClusterPlus (0)
consensusClustR (1)
consort (1)
ConsRank (1)
contentid (2)
contfrac (1)
contingencytables (1)
conumee (1)
convert (0)
coop (1)
CoordinateCleaner (1)
copa (0)
COPDSexualDimorphism.data (50)
copula (3)
CopyhelpeR (59)
CopyNeutralIMA (27)
copynumber (1)
CopyNumber450k (0)
CopyNumber450kData (8)
CopywriteR (0)
coRanking (1)
CoRegNet (1)
Cormotif (0)
CorMut (0)
coRNAi (0)
corncob (1)
coro (1)
corpcor (3)
corpora (1)
correlation (4)
CORREP (0)
corrplot (7)
corrr (1)
COSG (1)
CoSIAdata (25)
COSMIC.67 (136)
cosmiq (0)
cosmosR (1)
COSNet (0)
countrycode (11)
coveffectsplot (1)
covr (26)
covRNA (0)
cowplot (101)
coxme (1)
coxphf (1)
CoxPhLb (1)
coxphw (1)
cplm (1)
cpm (1)
cpp11 (209)
cpvSNP (0)
cqn (1)
cranlogs (1)
crayon (155)
crch (1)
CRCL18 (24)
creatr (1)
credentials (51)
crew (4)
crew.cluster (1)
CRImage (0)
CRISPR.shinyapp (0)
crisprScoreData (175)
crlmm (0)
cronR (1)
crop (1)
crossdes (1)
crossmatch (1)
crosstable (1)
crosstalk (138)
crrri (0)
crrry (0)
crul (80)
csaw (0)
CSSP (0)
csv (1)
ctc (0)
cubature (2)
cubelyr (0)
Cubist (1)
cummeRbund (0)
curatedAdipoArray (22)
curatedAdipoChIP (23)
curatedAdipoRNA (25)
curatedBladderData (70)
curatedBreastData (102)
curatedCRCData (35)
curatedMetagenomicData (300)
curatedOvarianData (247)
curatedPCaData (11)
curatedTBData (27)
curatedTCGAData (493)
curl (435)
customProDB (0)
cutoff (1)
cvar (1)
cvAUC (1)
cvms (1)
CVST (1)
cvTools (1)
CVXR (2)
cxAnalysis (0)
cycle (0)
cyclocomp (25)
cydar (1)
cyphr (1)
cytofkit (1)
cytolib (1)
CytoMethIC (12)
CytoML (1)
CytoTRACE (1)
Cytotree (1)
CytoTree (1)

D

D2C (1)
d3heatmap (1)
d3r (1)
d3treeR (1)
dada2 (0)
dae (1)
daff (1)
dagitty (1)
dagLogo (0)
DAISIE (1)
DALEX (1)
DALEX2 (1)
daMA (0)
DAMEfinder (1)
DAPAR (0)
DAPARdata (156)
dapr (1)
DARAtools (1)
DART (0)
DASiR (0)
dasnormalize.iomel (1)
dastools (1)
data.table (331)
data.tree (14)
DatabaseConnector (1)
dataCompareR (1)
DataEditR (0)
DataExplorer (1)
dataframes2xls (1)
dataMaid (1)
datamods (10)
DataOmnio (1)
datapasta (1)
datapipeline (1)
dataRetrieval (1)
datasauRus (1)
DataVisualizations (1)
datawizard (13)
date (1)
DAVIDQuery (0)
davidTiling (36)
dbaccess (1)
dbarts (3)
DBChIP (0)
DBI (323)
DBItest (1)
dblplyr (1)
dbplyr (231)
dbscan (7)
dbx (8)
dcat (1)
DCchoice (1)
dcdatr (1)
ddalpha (1)
DDCompanion (1)
ddCt (0)
ddgraph (0)
ddpcr (1)
DDRTree (1)
debugme (2)
DECIPHER (1)
deconfectHelpers (1)
DeconRNASeq (0)
deconstructSigs (1)
decontam (0)
decor (1)
decoupleR (1)
decoupler (1)
DEDS (0)
Deducer (1)
deEndometrial (1)
deepregression (1)
deepSNV (0)
deeptime (1)
DEGraph (0)
degreenet (1)
DEGseq (0)
Delaporte (1)
DelayedArray (6)
DelayedMatrixStats (14)
deldir (58)
demuxmix (1)
dendextend (25)
dendroextras (1)
DendSer (1)
dendsort (0)
densEstBayes (8)
densityClust (1)
densvis (1)
DEoptim (1)
DEoptimR (27)
DEP (1)
depmap (711)
derfinder (0)
derfinderData (90)
derfinderHelper (0)
Deriv (1)
desc (133)
descr (1)
descsuppR (1)
DescTools (19)
DESeq (0)
DESeq2 (5)
designmatch (1)
DEsingle (1)
deSolve (17)
DeSousa2013 (38)
destiny (1)
devEMF (1)
devtools (35)
devutils (1)
DExMAdata (76)
DEXSeq (1)
dexus (0)
dfidx (1)
dfoptim (1)
DFP (0)
DHARMa (1)
diagram (1)
DiagrammeR (3)
DiagrammeRsvg (1)
dials (16)
DiceDesign (13)
DiceKriging (1)
diceR (1)
dichromat (7)
did (1)
DiffBind (1)
diffdf (1)
diffGeneAnalysis (0)
diffHic (0)
DiffLogo (0)
diffloop (0)
diffloopdata (29)
diffobj (5)
diffviewer (1)
digest (417)
diggit (0)
diggitdata (39)
digitalDLSorteR (1)
dimRed (1)
Dino (1)
diptest (4)
dir.expiry (1)
directlabels (4)
DirichletMultinomial (1)
discretecdAlgorithm (1)
DiscriMiner (1)
disk.frame (1)
dismo (1)
distances (1)
distill (1)
distory (1)
distr (1)
distr6 (1)
distributional (17)
DistributionUtils (3)
distro (1)
dittodb (0)
dittoSeq (1)
DiurnalMRI (1)
dks (0)
DLBCL (106)
dlm (1)
dlookr (1)
dlstats (0)
dm (1)
DmelSGI (55)
DMRcaller (0)
DMRcate (1)
DMRcatedata (266)
DMRforPairs (0)
DMwR (1)
DNABarcodes (1)
DNAcopy (1)
DNAZooData (41)
dnet (1)
do (1)
DO.db (1)
doBy (4)
dockerfiler (1)
docopt (6)
DoE.base (1)
DoEstRare (0)
doFuture (1)
domainsignatures (0)
doMC (2)
doMPI (1)
DonaPLLP2013 (38)
donapllp2013 (0)
doParallel (13)
DOQTL (0)
doRedis (1)
doRNG (5)
dorothea (596)
DOSE (3)
Dose (0)
DoseFinding (1)
doseR (1)
doSNOW (1)
dotCall64 (10)
dotwhisker (1)
DoubletFinder (1)
downlit (97)
downloader (1)
downloadthis (1)
dparser (1)
dplyr (257)
dplyrb (1)
dpplyr (1)
dqrng (65)
drake (9)
drat (1)
drc (1)
DRDID (1)
dream (0)
DREAM4 (13)
dreamerr (1)
dressCheck (45)
drgee (1)
DriverNet (0)
DropletTestFiles (162)
DropletUtils (2)
DRR (1)
drugfindR (1)
DrugVsDisease (0)
DrugVsDiseasedata (147)
dsb (1)
dslabs (1)
dspNgs (0)
dsQTL (13)
dsr (3)
DSS (0)
DT (225)
DTA (0)
dtplyr (35)
dttr2 (1)
dtw (1)
dtwclust (1)
dualKS (0)
duckdb (4)
duct.tape (1)
dunn.test (1)
DuoClustering2018 (89)
DupChecker (0)
dupRadar (0)
dv.teal (1)
DvDdata (44)
dwrPlus (1)
dyebias (0)
dyebiasexamples (49)
dygraphs (1)
dynamicTreeCut (1)
DynDoc (1)
dynfeature (0)
dynlm (1)
dynplot (0)
dynpred (1)
dynsbm (1)
DynTxRegime (1)
dynwrap (0)

E

e1071 (61)
earth (3)
easierData (167)
easy.utils (1)
easyalluvial (1)
easyENTIM (1)
easypackages (1)
EasyqpcR (0)
easystats (3)
EatonEtAlChIPseq (45)
ebal (1)
EBarrays (0)
EBcoexpress (0)
EBImage (1)
EBSeq (0)
EBSeqHMM (0)
Ecdat (1)
ecfc (1)
Ecfun (1)
echarts4r (9)
ecodist (1)
ecoliLeucine (53)
ecolitk (0)
ECOSolveR (1)
ecospat (1)
Ecume (1)
EDDA (0)
edge (0)
edgeR (12)
effects (1)
effectsize (8)
egg (6)
egor (1)
EGSEAdata (186)
eha (1)
eisa (0)
elasticsearchr (1)
ELBOW (0)
elevatr (2)
ellipse (26)
ellipsis (15)
elliptic (1)
ELMER (1)
ELMER.data (217)
EMAtools (1)
emayili (2)
embed (1)
EMD (1)
emdbook (12)
emdist (1)
EMDomics (0)
emmeans (84)
EMMREML (1)
emoa (1)
emstreeR (1)
emtdata (28)
emulator (1)
enc (0)
encode (1)
ENCODEFig4Band4D (2)
encoDnaseI (11)
encryptr (0)
energy (1)
engitix.singlecell.db (1)
engitomixmk2 (0)
english (1)
enhancedvolcano (0)
EnhancedVolcano (1)
enmSdmX (1)
ENMTools (1)
EnrichedHeatmap (1)
enrichplot (2)
enrichPlot (1)
enrichR (2)
enrichwith (1)
EnsDb.Hsapiens.v75 (0)
EnsDb.Hsapiens.v86 (1)
ensembldb (4)
ensemblVEP (0)
ensurer (1)
entropy (1)
envalysis (1)
ENVISIONQuery (0)
EnvStats (2)
Epi (3)
EpiDISH (1)
epigenomix (0)
EpiMix.data (74)
epimutacionsData (85)
EpiNow2 (3)
epiR (3)
EpiStats (0)
epitools (1)
epuRate (1)
eq5d (1)
equatags (1)
equate (1)
equivalence (1)
erccdashboard (0)
ergm (1)
ergm.multi (1)
erify (1)
erma (0)
errorlocate (1)
escape (1)
eset (1)
ESNSTCC (0)
esquisse (5)
estimability (28)
estimatr (1)
estmeansd (1)
estrogen (93)
etec16s (24)
etm (1)
eudysbiome (0)
eulerr (1)
europepmc (1)
evaluate (415)
EValue (2)
evd (4)
eventdataR (1)
eventPrediction (1)
eventTrack (1)
ewceData (227)
ewfutils (1)
Exact (1)
exact2x2 (1)
exactci (1)
exactextractr (1)
exactRankTests (2)
excelR (1)
ExiMiR (0)
exomeCopy (0)
ExomeDepth (1)
ExperimentHub (1)
ExperimentHubData (1)
expint (1)
explorase (0)
explore (1)
ExploreModelMatrix (0)
ExplorOMICS (1)
expm (22)
ExpressionView (0)
expss (3)
extraChIPs (1)
extraDistr (8)
extrafont (3)
extrafontdb (1)
extraInserts (0)
extraoperators (1)
extraTrees (0)
extRemes (1)

F

faahKO (315)
fabia (0)
fabiaData (33)
fable (1)
fabletools (3)
facopy.annot (5)
facsDorit (16)
factDesign (0)
factoextra (6)
FactoInvestigate (1)
FactoMineR (26)
Factoshiny (1)
fairhub.metadata (1)
fairhub.r.client (1)
fakepackage (1)
fANCOVA (3)
fansi (269)
FANTOM3and4CAGE (47)
faraway (1)
farms (0)
farver (130)
fastcluster (7)
fastDummies (21)
fasterize (1)
fastGHQuad (1)
fastICA (19)
fastmap (183)
fastmatch (31)
fastmatrix (1)
fastqcr (1)
fastreeR (0)
fastseg (1)
fastshap (1)
fasttime (1)
fastverse (1)
faux (1)
fauxpas (1)
fBasics (3)
FCBF (1)
fCI (0)
FD (1)
fda (12)
FDb.InfiniumMethylation.hg19 (0)
fdrame (0)
fdrtool (3)
fds (6)
feasts (3)
feather (1)
feature (7)
FedData (0)
feisr (1)
FEM (0)
fenr (1)
fExtremes (6)
ff (17)
FField (1)
ffpe (0)
ffpeExampleData (53)
fftw (1)
fftwtools (1)
fGarch (5)
FGNet (0)
fgsea (1)
fibroEset (89)
fido (1)
FieldEffectCrc (21)
fields (7)
filehash (1)
filelock (83)
filesstrings (1)
finalfit (1)
FindMyFriends (0)
findpython (12)
fineimp (1)
FineR (1)
finetune (1)
fingerprint (1)
FIs (68)
FISHalyseR (0)
fission (229)
fit.models (1)
fitdistrplus (25)
fixest (1)
flagme (0)
flair (1)
flashClust (1)
Fletcher2013a (80)
Fletcher2013b (65)
flexclust (2)
flexdashboard (3)
flexmix (2)
flexsurv (1)
flexsurvcure (1)
flextable (30)
flipflop (0)
float (2)
flock (1)
flowAI (0)
flowBeads (0)
flowBin (0)
flowcatchR (0)
flowCHIC (0)
flowCL (0)
flowClean (0)
flowClust (1)
flowCore (1)
FlowCore (0)
flowCyBar (0)
flowDensity (0)
flower (1)
flowFit (0)
flowFitExampleData (10)
flowFP (0)
flowMap (0)
flowMatch (0)
flowMeans (0)
flowMerge (0)
flowPeaks (0)
flowPloidyData (53)
flowPlots (0)
flowQB (0)
flowQBData (4)
FlowRepositoryR (0)
FlowSOM (0)
FlowSorted.Blood.450k (330)
FlowSorted.Blood.EPIC (197)
FlowSorted.CordBlood.450k (45)
FlowSorted.CordBloodCombined.450k (50)
FlowSorted.CordBloodNorway.450k (30)
FlowSorted.DLPFC.450k (114)
flowStats (1)
flowTrans (0)
flowType (0)
flowUtils (0)
flowViz (0)
flowVS (0)
flowWorkspace (0)
flowWorkspaceData (175)
flux (1)
fma (1)
fmcsR (0)
FME (1)
fmsb (1)
FMStable (1)
fmtr (1)
FNN (139)
focalCall (0)
foghorn (1)
fontawesome (112)
fontBitstreamVera (1)
fontcm (1)
fontLiberation (1)
fontquiver (1)
forcats (26)
foreach (10)
forecast (10)
foreign (63)
forestmodel (1)
forestplot (1)
forestploter (1)
forge (1)
fork (1)
formatR (52)
formattable (1)
formatters (5)
Formula (18)
formula.tools (1)
forrester.metadata (0)
fortunes (1)
FourCSeq (0)
fourDNData (40)
fpc (59)
fpp2 (1)
fracdiff (5)
FragPipeAnalystR (1)
frailtypack (3)
FRASER (1)
freetypeharfbuzz (1)
fresh (11)
FrF2 (1)
FRGEpistasis (0)
frictionless (1)
frma (0)
frmaExampleData (54)
frmaTools (0)
fs (233)
FSA (1)
fst (1)
fstcore (1)
ftExtra (1)
fTrading (1)
fucci (0)
FunciSNP (0)
FunciSNP.data (12)
fungible (1)
fUnitRoots (1)
funkyheatmap (1)
furniture (1)
furrowSeg (28)
furrr (15)
futile.logger (1)
futile.options (1)
future (200)
future.apply (175)
future.batchtools (1)
future.callr (5)
fuzzyjoin (1)
fuzzySim (1)
fwb (1)

G

g3viz (1)
GA (91)
gaga (0)
gage (0)
gageData (294)
gaggle (0)
gaia (0)
gam (12)
GAMBLR.results (1)
GAMBoost (1)
gamboostLSS (2)
gameofthrones (1)
gamlss (4)
gamlss.add (2)
gamlss.data (2)
gamlss.dist (4)
gamm4 (1)
gap (1)
gap.datasets (1)
gapminder (1)
gargle (57)
gaschYHS (32)
gaston (1)
GastrographPackage (1)
gatingMLData (16)
gaucho (0)
gausscov (1)
gbm (93)
gbRd (1)
gbutils (1)
gcatest (0)
gclus (1)
gCMAP (0)
gCMAPWeb (0)
gcrma (1)
gcspikelite (109)
gdata (22)
gDNAinRNAseqData (56)
gDRtestData (62)
gdsfmt (1)
gdsx (1)
gdtools (104)
gee (1)
geeasy (2)
geecc (0)
geepack (7)
geigen (1)
gemini (1)
gemma.R (0)
gemtc (1)
GenABEL (2)
GenABEL.data (2)
genArise (0)
GENE.E (0)
GeneAnswers (0)
GeneBreak (0)
GeneExpressionSignature (0)
genefilter (2)
genefu (0)
geneLenDataBase (1754)
genelendatabase (1)
GeneMeta (0)
GeneNetworkBuilder (0)
GeneNMF (1)
GeneOverlap (0)
geneplotter (1)
GeneralizedHyperbolic (2)
geneRecommender (0)
GeneRegionScan (0)
generics (30)
geneRxCluster (0)
GeneSelectMMD (0)
GeneSelector (0)
GENESIS (0)
geNetClassifier (0)
genetics (1)
GeneticsDesign (0)
GeneticsPed (0)
GENIE3 (0)
genoCN (0)
genomationData (90)
GenomeGraphs (0)
GenomeInfoDb (21)
GenomeInfoDbData (5)
genomeinfodbdata (1)
genomeIntervals (0)
GenomicAlignments (3)
GenomicDistributionsData (76)
GenomicFeatures (15)
GenomicFeatures.Hsapiens.UCSC.hg18 (2)
GenomicFeatures.Mmusculus.UCSC.mm9 (2)
GenomicFiles (0)
GenomicRanges (4)
GenomicTools (0)
GenomicTuples (0)
Genominator (0)
GenOrd (1)
genoset (0)
genotypeeval (0)
GenoView (0)
GenSA (2)
geobr (1)
geodata (1)
geodiv (1)
geohashTools (1)
geojson (1)
geojsonio (1)
geojsonlint (1)
geojsonsf (1)
GEOmap (8)
GEOmetadb (0)
geometries (22)
geometry (1)
geomorph (1)
geomtextpath (1)
GeomxTools (0)
GEOquery (1)
geoR (1)
geos (1)
geosphere (12)
GEOsubmission (0)
GeoTcgaData (1)
gert (102)
gespeR (0)
gestalt (7)
gestate (1)
getip (2)
getopt (27)
GetoptLong (4)
getPass (3)
gettz (1)
GeuvadisTranscriptExpr (49)
geuvPack (5)
geuvStore (2)
geuvStore2 (6)
GEWIST (0)
gfonts (1)
ggalluvial (1)
GGally (23)
ggalt (1)
gganimate (1)
GGBase (0)
ggbeeswarm (6)
ggbio (1)
ggbiploti (1)
ggbreak (1)
ggchicklet (1)
ggcorrplot (2)
ggdag (1)
GGdata (18)
ggdendro (17)
ggdensity (1)
ggdist (7)
gge (1)
ggeasy (1)
ggedit (1)
ggeffects (4)
ggExtra (6)
ggfittext (2)
ggforce (42)
ggformula (31)
ggfortify (2)
ggfun (67)
gggenes (1)
ggh4x (3)
gghalves (1)
gghighlight (1)
ggimage (1)
gginnards (1)
ggiraph (8)
ggiraphExtra (1)
gglm (1)
ggm (1)
ggmap (11)
ggmosaic (1)
ggmsa (1)
ggnetwork (1)
ggnewscale (52)
ggnewscales (0)
gGnome (1)
ggokabeito (1)
ggpattern (1)
ggplot (1)
ggplot2 (382)
ggplot2movies (1)
ggplotify (34)
ggpmisc (7)
ggPMX (1)
ggpointdensity (7)
ggpp (8)
ggprism (2)
ggpubr (27)
ggRandomForests (0)
ggrap2 (1)
ggraph (33)
ggrastr (8)
ggrepel (258)
ggridges (43)
ggsci (66)
ggseqlogo (16)
ggside (5)
ggsignif (13)
ggspatial (1)
ggstance (2)
ggstats (5)
ggstatsplot (3)
ggsurvfir (0)
ggsurvfit (2)
ggtern (62)
ggtext (4)
ggthemes (15)
ggtree (14)
ggtreeDendro (0)
ggtreeExtra (1)
ggtut (11)
ggupset (1)
ggvenn (1)
ggVennDiagram (3)
ggvis (1)
ggwordcloud (1)
gh (121)
ghpm (1)
ghql (0)
gifski (1)
GIGSEAdata (20)
gimme (1)
Giotto (0)
git2r (20)
gitcreds (22)
gitlabr (1)
gittargets (1)
GLAD (0)
glassoFast (1)
glca (1)
gld (1)
Glimma (1)
glmGamPoi (1)
glmGamPoiR (1)
GLMMadaptive (1)
glmmADMB (0)
glmmML (1)
glmmTMB (3)
glmnet (26)
glmnetUtils (11)
glmperm (1)
glmx (1)
GlobalAncova (0)
GlobalOptions (2)
globals (61)
globals, (0)
globaltest (0)
glpkAPI (1)
glue (170)
gmailr (2)
gMCP (1)
GMD (0)
Gmisc (1)
gmm (2)
gmnl (1)
gmodels (2)
gmp (18)
gmthemes (1)
gnm (1)
GO.db (3)
godmode (1)
goftest (2)
GOFunction (0)
golem (8)
golubEsets (245)
golubesets (0)
gongs (1)
goodpractice (1)
googleAuthR (3)
googleCloudStorageR (1)
googledrive (44)
googlesheets (1)
googlesheets4 (52)
googleVis (2)
GOSemSim (1)
goseq (0)
goshawk (1)
GOstats (1)
gower (17)
gpaExample (36)
GPArotation (13)
GPfit (1)
gplots (126)
gprofiler2 (3)
grafify (1)
gRain (1)
gralarkivar (1)
granny (0)
graper (1)
graph (1)
GraphGallery (1)
graphiQs (1)
graphite (0)
graphlayouts (58)
graphql (1)
graphsim (1)
grates (3)
gRbase (1)
greekLetters (1)
Greg (1)
greybox (1)
grf (1)
grid (1)
gridBase (1)
gridExtra (1)
gridGraphics (2)
gridpattern (1)
gridSVG (1)
gridtext (3)
grImport (1)
grImport2 (1)
grndata (43)
groupdata2 (1)
grpreg (1)
grr (1)
GSA (1)
gsbDesign (1)
GSBenchMark (77)
gscounts (1)
gscreend (1)
gsDesign (1)
GSE103322 (36)
GSE13015 (32)
GSE159526 (20)
GSE62944 (64)
GSEABase (1)
GSEAbase (1)
gsignal (1)
gskb (5)
gsl (3)
gsmoothr (6)
gson (6)
gsrc (0)
gss (4)
gstat (1)
gsubfn (1)
GSVA (1)
GSVAdata (750)
gt (22)
gtable (221)
gtExtras (1)
gto (1)
gtools (58)
gtrellis (1)
gtsummary (3)
gtx (0)
gubraqsar (0)
GUniFrac (2)
gupio (1)
Gviz (2)
gwascat (1)
GWASdata (88)
GWASExactHW (6)
gwasrapidd (1)
GWASTools (0)
gwasvcf (1)
GWENA (0)
gWidgets (1)
gWidgets2tcltk (0)
gWidgetstcltk (1)

H

h2o (5)
h5vcData (139)
HAC (1)
hahmmr (1)
hal9001 (1)
HandTill2001 (1)
haplo.stats (1)
HaploSim (0)
haplotrackR (1)
hapmap100khind (35)
hapmap100kxba (60)
hapmap500knsp (43)
hapmap500ksty (53)
hapmapsnp5 (161)
hapmapsnp6 (193)
harbChIP (36)
hardhat (54)
HardyWeinberg (1)
HarmanData (43)
HarmonizedTCGAData (28)
harmony (9)
hash (3)
haven (98)
HCAData (77)
HCATonsilData (39)
HD2013SGI (52)
HDCytoData (236)
hdf5 (1)
HDF5Array (12)
hdf5r (12)
hdf5r.Extra (1)
hdi (1)
HDInterval (12)
HDLSSkST (1)
HDmap (1)
hdnom (1)
HDO.db (1)
hdrcde (6)
healthyControlsPresenceChecker (19)
healthyFlowData (50)
heatmap.plus (1)
heatmaply (21)
HEEBOdata (46)
heemod (0)
HelloRangesData (83)
heplots (1)
here (2)
heritability (1)
Herper (0)
hexbin (18)
hexSticker (1)
hexView (1)
HGNChelper (1)
hgu133a.db (1)
hgu133abarcodevecs (26)
hgu133afrmavecs (4)
hgu133plus2.db (1)
hgu133plus2barcodevecs (25)
hgu133plus2CellScore (38)
hgu133plus2frmavecs (3)
hgu2beta7 (27)
hgu95a.db (0)
hgu95av2.db (1)
HiBED (18)
HiCBricks (0)
HiCDataHumanIMR90 (54)
HiCDataLymphoblast (44)
HiClimR (0)
HiContactsData (96)
hierfstat (0)
highcharter (1)
highlight (0)
HighlyReplicatedRNASeq (22)
highr (133)
highs (1)
Hiiragi2013 (115)
HilbertCurve (1)
HilbertVis (1)
HiTC (1)
HiTME (1)
HIVcDNAvantWout03 (28)
Hmisc (43)
HMMcopy (1)
HMP16SData (38)
HMP2Data (41)
hms (80)
hmyriB36 (13)
hoardr (1)
Homo.sapiens (0)
homosapienDEE2CellScore (7)
Hoover (1)
hopach (0)
howmany (1)
HPC.R.Utilities (1)
hrbrthemes (3)
HSAUR2 (0)
HSAUR3 (1)
hsm (0)
HSMMSinglece11 (0)
HSMMSinglecel1 (0)
HSMMSingleCell (2870)
htmlTable (37)
htmltools (390)
htmlwidgets (213)
HTqPCR (0)
httpcode (1)
httpgd (2)
httptest (4)
httptest2 (1)
httput (1)
httpuv (351)
httr (170)
httr2 (135)
huge (1)
hugene10sttranscriptcluster.db (1)
HumanAffyData (36)
HumanPrimaryCellAtlasData (1)
humanStemCell (152)
hunspell (14)
huxtable (3)
hwriter (4)
hydroPSO (1)
hypergate (1)
hypergeo (1)
hyperSpec (1)
hypred (1)

I

IAPWS95 (1)
iatlas.app (1)
iatlasGraphQLClient (1)
iBreakDown (1)
iC10 (1)
iC10TrainingData (1)
ica (4)
ICC (1)
icenReg (1)
Icens (1)
ichorCNA (1)
iCiteR (1)
ICS (1)
ICSNP (1)
ICSOutlier (1)
IDEAFilter (1)
idorsiaQC (1)
IDPmisc (5)
idr (0)
ids (1)
ifnb.SeuratData (1)
iGasso (0)
igraph (188)
igraphdata (1)
igvShiny (1)
iheatmapr (5)
IHW (1)
IHWpaper (38)
ijtiff (1)
Illumina450ProbeVariants.db (594)
IlluminaDataTestFiles (98)
IlluminaHumanMethylation450kanno.ilmn12.hg19 (1)
IlluminaHumanMethylation450kmanifest (3)
IlluminaHumanMethylationEPICanno.ilm10b2.hg19 (1)
illuminaio (1)
imager (2)
imbalance (1)
imcdatasets (70)
imcRtools (0)
iml (1)
immunarch (1)
impmap (1)
import (3)
ImpulseDE2 (0)
impute (1)
imputeLCMD (1)
imputeTS (1)
IncDTW (1)
incidence (3)
incidence2 (3)
IncidencePrevalence (1)
ind1KG (11)
iNEXT (1)
infer (16)
infercnv (1)
influenceR (2)
InformationValue (1)
infotheo (1)
ingredients (1)
ini (1)
InkblotAnalytics (9)
INLA (0)
inline (1)
inlinedocs (1)
InraeThemes (1)
insight (17)
installr (1)
intamap (1)
intansv (0)
InteractionSet (1)
InteractiveComplexHeatmap (1)
interactiveDisplayBase (1)
interactomes (1)
intergraph (1)
interp (19)
interval (1)
intervals (6)
inum (4)
invgamma (1)
iontreeData (10)
iotools (1)
ipaddress (1)
IPCAPS (1)
ipcwswitch (1)
IPDfromKM (1)
ipred (30)
ips (2)
iptmnetr (1)
ipw (1)
iq (1)
IRanges (22)
IRdisplay (1)
IRkernel (0)
irlba (22)
irr (1)
iSEE (1)
ISLR (1)
Iso (1)
isoband (53)
ISOcodes (1)
IsoCorrectoR (1)
IsoCorrectoRGUI (1)
isva (6)
ISwR (1)
ITALICSData (60)
iterators (10)
itertools (1)
ITKR (1)
itsadug (1)
ivpack (0)
ivprobit (1)
ivreg (1)
Iyer517 (32)

J

JADE (1)
jagsUI (1)
janeaustenr (4)
janitor (6)
JASPAR2014 (99)
JASPAR2016 (168)
JavaGD (1)
JBrowseR (1)
jcolors (1)
JctSeqData (6)
jctseqdata (0)
JGR (1)
JM (1)
JMbayes (1)
jnjtemplates (1)
job (1)
Johnson (1)
JohnsonKinaseData (9)
joineRML (1)
jomo (1)
jonasrscripts (1)
jose (2)
jpeg (18)
jqr (9)
jquerylib (2)
js (1)
jskm (1)
jsonify (1)
jsonlite (243)
jsonvalidate (1)
jsTreeR (1)
jtools (1)
juicyjuice (1)
JuliaCall (0)

K

kableExtra (23)
kangar00 (1)
KaryoploteR (0)
karyoploteR (1)
katex (1)
KEGG.db (1)
KEGGandMetacoreDzPathwaysGEO (97)
KEGGdzPathwaysGEO (351)
KEGGgraph (1)
keggorthology (0)
KEGGprofile (0)
KEGGREST (11)
keggsvg (1)
Kendall (1)
keras (8)
KernelKnn (1)
kernlab (19)
KernSmooth (82)
keyring (6)
KFAS (1)
khroma (1)
kidpack (33)
kinship2 (2)
kit (1)
kknn (1)
klaR (4)
km.ci (2)
kmed (1)
kml (1)
kml3d (1)
kmlShape (1)
KMsurv (1)
knitr (331)
knitrdata (1)
knockoff (1)
KOdata (101)
kohonen (1)
kpmt (0)
kriging (1)
ks (9)
kSamples (2)
ktplots (0)
kutils (1)
kyotil (1)

L

L1pack (1)
l2p (1)
labdsv (1)
labeling (180)
labelled (13)
laeken (2)
Lahman (1)
lambda.r (2)
lambdr (1)
LambertW (3)
lamW (3)
landscapemetrics (1)
languageserver (2)
LaplacesDemon (1)
lares (1)
lars (1)
lasso2 (1)
lastdose (1)
latentnet (1)
later (189)
latex2exp (1)
lattice (209)
latticeExtra (13)
lava (57)
lavaan (24)
lavaSearch2 (1)
lazy (1)
lazyeval (11)
lbaQcCheck (1)
LBE (1)
lbfgs (1)
lbfgsb3c (1)
lcopula (1)
lda (1)
ldap (1)
LDheatmap (1)
LDlinkR (1)
LDplots (1)
LEA (1)
leafem (2)
leaflegend (3)
leaflet (9)
leaflet.extras (3)
leaflet.minicharts (0)
leaflet.providers (3)
leafpop (1)
leaps (7)
LearnBayes (1)
learnr (7)
leeBamViews (70)
leiden (28)
leidenAlg (1)
leidenbase (13)
lemon (2)
leukemiasEset (144)
leukemiaseset (1)
lfa (0)
lfda (1)
lfe (1)
lgr (2)
lhs (14)
liana (1)
libcoin (5)
libgeos (1)
LiblineaR (12)
libr (1)
LiebermanAidenHiC2009 (31)
lifecycle (225)
liftOver (1)
liger (2)
lightgbm (3)
lime (1)
limma (37)
limmaGUI (0)
limmia (1)
limSolve (1)
LinMod2 (1)
Linnorm (0)
linprog (1)
lintr (101)
listenv (62)
ListerEtAlBSseq (30)
listviewer (1)
littler (1)
lixoftConnectors (0)
lixoftConnectors.1 (0)
lixoftConnectors.2 (0)
lm.beta (1)
lme4 (144)
lmerTest (2)
LMI (1)
LMMsolver (1)
lmodel2 (1)
lmom (14)
lmomco (1)
Lmoments (1)
lmtest (6)
lobstr (4)
locfit (108)
log4r (5)
logcondens (1)
logger (14)
logging (1)
LogicReg (1)
logistf (12)
logitnorm (1)
logitr (1)
logr (1)
logrrr (1)
logrx (1)
logspline (1)
lokern (1)
LOLA (1)
longComplexHeatmap (1)
longitudinalData (1)
loo (16)
LoomExperiment (0)
lotri (1)
LowRankQP (1)
lpridge (1)
lpSolve (16)
lpSolveAPI (2)
lpsymphony (1)
lqmm (1)
LRcellTypeMarkers (38)
lsa (8)
lsei (2)
lsmeans (1)
lubridate (105)
lumi (1)
lumiBarnes (62)
Luminescence (1)
LungCancerACvsSCCGEO (70)
LungCancerLines (77)
lungExpression (72)
lvec (1)
lwgeom (4)
lydata (157)
lymphoma (1)

M

m03modeldevelopment (1)
M3DExampleData (124)
M3Drop (0)
Maaslin2 (0)
maboost (1)
macrophage (300)
MACSdata (39)
MACSr (1)
maditr (1)
madness (0)
MafDb.ALL.wgs.phase1.release.v3.20101123 (3)
MafDb.ESP6500SI.V2.SSA137.dbSNP138 (2)
MafDb.gnomAD.r2.1.hs37d5 (1)
maftools (1)
magic (2)
magicaxis (1)
magick (18)
magrittr (26)
maic (1)
maicChecks (1)
mailR (0)
MAIT (0)
makecdfenv (0)
maketools (1)
MALDIquant (4)
mammaPrintData (36)
manipulate (1)
manipulateWidget (1)
maotai (1)
mapbayr (0)
mapdata (1)
mAPKLData (15)
mapplots (1)
mapproj (2)
maps (15)
maptools (22)
maptree (1)
mapview (2)
maqcExpression4plex (58)
MAQCsubset (51)
MAQCsubsetAFX (16)
MAQCsubsetILM (23)
marginaleffects (1)
margins (1)
marinerData (45)
Markdown (0)
markdown (109)
markovchain (1)
marqLevAlg (1)
marray (1)
maser (1)
maSigPro (0)
MASS (331)
MassSpecWavelet (1)
MAST (1)
Matching (3)
MatchIt (4)
MatchThem (1)
mathjaxr (2)
matlib (1)
Matri (1)
Matrix (416)
matrix (1)
Matrix.utils (1)
matrixcalc (1)
MatrixEQTL (1)
MatrixExtra (1)
MatrixGenerics (3)
MatrixModels (109)
matrixStats (224)
matrixTests (1)
maxLik (1)
maxstat (1)
MBA (7)
mbend (1)
MBESS (1)
mboost (3)
mc2d (2)
MCAData (0)
mclogit (1)
mclust (21)
mclustcomp (1)
mcmc (2)
mcmcabn (1)
MCMCglmm (1)
MCMCpack (3)
MCMCprecision (1)
MCPcounter (0)
mcr (8)
mCSEAdata (124)
mcsurvdata (25)
mctq (1)
mcv (1)
mda (1)
mdmb (1)
MEALData (4)
measurements (1)
measures (1)
mediation (1)
MEDIPSData (73)
MEEBOdata (46)
memisc (1)
memoise (17)
MEMSS (1)
memuse (1)
MendelianRandomization (3)
merDeriv (1)
MerfishData (44)
merge (1)
merTools (1)
MeSHDbi (1)
MESS (2)
meta (1)
Metab (0)
metabaser (1)
metaBLUE (1)
metaBMA (1)
MetaboAnalystR (1)
metabolomics (1)
MetaboReport (1)
metacore (1)
metadat (1)
metafor (6)
metagenomeSeq (1)
MetaGxBreast (34)
MetaGxOvarian (30)
MetaGxPancreas (28)
metaMA (8)
metaMS (0)
metaMSdata (124)
metan (1)
metap (11)
metaplot (1)
metaplus (1)
metapod (1)
MetaScope (25)
metatools (1)
MetaUtility (1)
methyAnalysis (0)
MethylAidData (64)
methylclock (1)
methylclockData (169)
methylKit (1)
MethylMix (0)
MethylSeqData (22)
methylumi (1)
methyvimData (5)
metR (1)
Metrics (1)
metricsgraphics (1)
metrumrg (1)
mets (2)
MetStaT (1)
mev (1)
mFilter (0)
Mfuzz (0)
mfx (1)
mgcv (263)
mgm (1)
mgvc (1)
mhsmm (1)
mhurdle (1)
mi (1)
mia (0)
miaViz (0)
mice (15)
miceadds (1)
MicrobaCommunityProfileReader (1)
microbenchmark (1)
microbiome (1)
MicrobiomeBenchmarkData (42)
microbiomeDataSets (173)
microeco (1)
micromap (0)
microRNAome (29)
microseq (1)
Microsoft365R (1)
MIGSAdata (9)
miloR (1)
mime (30)
mimosa (1)
minet (1)
minfi (1)
minfiData (491)
minfiDataEPIC (110)
miniCRAN (1)
minionSummaryData (54)
miniUI (2)
minpack.lm (6)
minqa (122)
mirai (3)
miRBaseVersions.db (1)
miRcompData (67)
miRNATarget (70)
mirt (10)
misc3d (1)
miscTools (1)
missForest (1)
missMDA (2)
missMethyl (1)
missRanger (2)
misty (1)
mitml (1)
mitoODEdata (9)
mitools (1)
mix (1)
mixOmics (1)
mixsqp (22)
mixtools (2)
mixture (1)
MKmisc (1)
mlbench (13)
MLEcens (1)
mlegp (1)
mlfa (1)
mlflow (1)
MLmetrics (1)
mlmm (1)
mlmm.gwas (0)
mlmRev (1)
mlogit (1)
mlpack (1)
mlr (1)
mlr3 (3)
mlr3cluster (1)
mlr3data (1)
mlr3filters (1)
mlr3fselect (1)
mlr3hyperband (1)
mlr3learners (2)
mlr3measures (1)
mlr3misc (2)
mlr3pipelines (2)
mlr3proba (1)
mlr3spatiotempcv (1)
mlr3tuning (1)
mlr3tuningspaces (1)
mlr3viz (1)
mlt (1)
mma (1)
MMAPPR2data (34)
MMDiffBamSubset (50)
mmrm (40)
mnormt (18)
MNP (0)
mockery (4)
mockr (1)
modeest (1)
modelbased (3)
modeldata (15)
modelenv (1)
ModelMetrics (2)
modelObj (1)
modelr (38)
ModelR (1)
modelsummary (1)
modeltests (1)
modeltime (1)
modeltime.ensemble (1)
modeltools (1)
modetest (1)
modEvA (1)
MODIStsp (2)
modules (3)
MOFA (1)
MOFA2 (1)
MOFAdata (174)
moleculaR (1)
moments (3)
Momocs (1)
monaLisa (1)
mondate (1)
mongolite (1)
monkey (1)
monocle (1)
monocle3 (1)
MonoPhy (2)
morpheus (1)
Morpho (1)
mosaic (1)
mosaicCore (31)
mosaicData (1)
mosaicsExample (89)
motifmatchr (2)
mouse4302barcodevecs (25)
mouse4302frmavecs (3)
MouseAgingData (10)
mousecortexref.SeuratData (1)
MouseGastrulationData (155)
MouseThymusAgeing (66)
MPA (0)
MplusAutomation (1)
mpm (1)
mpn.scorecard (1)
mppR (0)
MPV (1)
mratios (1)
mregions (1)
mrgda (1)
mrggsave (1)
mrgmisc (1)
mrgsolve (1)
mrgvalidate (1)
mrgvalprep (1)
msa (0)
msatR (1)
MSBdata (5)
MsCoreUtils (1)
msd16s (46)
msdata (577)
MsFeatures (0)
msigdb (623)
msigdbr (6)
msiImporter (1)
msm (6)
MSMB (71)
MSnbase (1)
Msnbase (1)
msPurityData (50)
msqc1 (24)
MSstats (1)
MSstatsBioData (5)
MSstatsConvert (1)
MSstatsLiP (1)
MSstatsTMT (1)
MSstatsTMTs (0)
mstate (1)
MSwM (1)
mtbls2 (101)
MTseekerData (4)
MUGAExampleData (41)
muhaz (1)
Mulder2012 (13)
muleaData (8)
multcomp (102)
multcompView (20)
multgee (1)
MultiAssayExperiment (1)
multicool (8)
multicross (1)
MultiDataSet (1)
multidplyr (0)
multiGSEA (1)
multimode (1)
multinichenetr (0)
multinma (1)
multipanelfigure (2)
multiplex (1)
multiwayvcov (1)
multiWGCNAdata (19)
multtest (1)
MuMIn (2)
munsell (106)
muscat (1)
muscData (161)
muscle (0)
MutationalPatterns (0)
mutoss (9)
mvabund (1)
mvna (1)
mvnfast (0)
mvnormtest (1)
mvoutData (48)
mvtnorm (141)
mwcsr (1)
mycor (1)
mygene (0)
myphd (0)
mzID (0)
mzR (1)

N

n1qn1 (1)
N2R (1)
nabor (1)
NACHO (1)
NADA (6)
NADIA (1)
name (1)
namer (1)
namespace (1)
naniar (4)
nanoarrow (1)
nanonext (3)
nanopipeline (1)
NanoporeRNASeq (52)
NanoPyx (1)
NanoStringDiff (1)
NanoStringNCTools (0)
NanoStringNorm (1)
NanoStringQCPro (1)
nanostringr (1)
nanotime (1)
nanotubes (32)
narray (1)
nasapower (1)
nat.util (1)
nat.utils (1)
natserv (1)
naturalsort (1)
NbClust (1)
nbpMatching (1)
NBPSeq (1)
ncappc (1)
ncar (1)
ncdf4 (13)
ncdf4.1 (0)
ncdfFlow (1)
NCIgraphData (30)
ncigraphdata (1)
ncmeta (3)
NCmisc (1)
ncvreg (1)
ndexr (0)
ndjson (0)
Nebulosa (1)
neo2R (1)
NEONiso (1)
neonUtilities (1)
nephro (1)
nestcolor (1)
nestedcv (1)
nestedLogit (1)
nestedmodels (1)
NestLink (26)
NetActivityData (53)
NetBID2 (1)
netDx.examples (1)
netmeta (1)
NetPreProc (1)
netrankr (1)
NetRep (1)
NetSwan (1)
network (3)
networkD3 (1)
networkDynamic (1)
neuralnet (1)
NeuralNetTools (1)
Neve2006 (43)
nFactors (1)
NGCHM (1)
NGScopyData (55)
ngsReports (0)
NHANES (1)
nhanesA (0)
nimble (1)
nipals (1)
NISTunits (1)
NlcOptim (1)
nleqslv (2)
nlme (235)
nlmeODE (1)
nlmixr2 (1)
nlmixr2data (1)
nlmixr2est (1)
nlmixr2extra (1)
nlmixr2lib (1)
nlmixr2plot (1)
nlmixr2rpt (1)
nloptr (45)
NLP (1)
nls2 (1)
NMcalc (1)
NMdata (1)
NMF (14)
NMproject (1)
nmrec (1)
NMsim (1)
nnet (55)
NNgenesets (1)
NNLM (1)
nnls (5)
NNutils (1)
noctua (1)
NOISeq (1)
nominatimlite (1)
NonCompart (1)
nonmem2R (1)
nonmem2rx (1)
nonmemica (1)
nonnest2 (1)
nor1mix (3)
norm (2)
NormalizerDE (1)
NormalyzerDE (1)
NORMT3 (1)
nortest (1)
notame (1)
Nozzle.R1 (1)
npde (1)
nphRCT (1)
npsurv (2)
nullrangesData (206)
numbat (9)
numbers (1)
numDeriv (2)
NxtIRFdata (100)
nycflights13 (1)

O

oaqc (1)
ObMiTi (21)
oce (1)
oct4 (40)
octad.db (59)
od (1)
odbc (26)
odyproteomicsValidator (0)
officedown (2)
officer (30)
oligo (1)
oligoClasses (1)
OlinkAnalyze (1)
olsrr (1)
OmicCircos (0)
omicsbase (0)
OMICsPCAdata (83)
omnibus (1)
OmnipathR (1)
omopgenerics (1)
ompr (1)
ompr.roi (1)
OnassisJavaLibs (37)
onbrand (1)
OncoBayes2 (1)
oncomarkerbase (1)
oneChannelGUI (0)
ontologyIndex (21)
ontologyPlot (1)
ontoProc (0)
oompaBase (6)
oompaData (5)
opdisDownsampling (1)
openCyto (1)
openeo (1)
OpenMx (1)
openssl (427)
openxlsx (52)
openxlsx2 (1)
operator.tools (1)
optextras (1)
optimalFlowData (72)
optimParallel (1)
optimr (1)
optimx (11)
optmatch (3)
optparse (46)
optpart (1)
optweight (1)
orca (1)
OrderedList (1)
ordinal (4)
ore (1)
org.Ag.eg.db (1)
org.At.tair.db (1)
org.Dm.eg.db (0)
org.Dr.eg.db (0)
org.Hs.eg.db (3)
org.Hs.eg.dB (1)
org.Mm.eg.db (2)
org.Pf.plasmo.db (1)
org.Psativumv2.eg.db (1)
org.Rn.eg.db (1)
org.Sc.sgd.db (1)
org.Ss.eg.db (0)
OrganismDbi (1)
oricvis (1)
orientlib (1)
origami (1)
orthogene (0)
orthopolynom (1)
orthosData (70)
oskeyring (1)
osmdata (10)
osprey (1)
osqo (1)
osqp (3)
outliers (1)
OUTRIDER (1)
overlapping (1)

P

PAA (0)
packcircles (1)
packer (1)
packrat (38)
pacman (1)
padr (1)
pagedown (2)
pagoda2 (0)
PAIRADISE (1)
PairedData (1)
pak (3)
paletteer (9)
palmerpenguins (1)
palr (1)
pals (3)
pammtools (1)
pamr (1)
pan (2)
pander (5)
pandoc (1)
panelr (1)
paquet (1)
paradox (1)
parallelDist (1)
parallelly (182)
parallelMap (1)
parallely (1)
param6 (1)
parameters (12)
ParamHelpers (1)
parathyroid (6)
parathyroidSE (347)
parathyroidse (1)
parcats (1)
PARdesign (1)
parrallely (1)
parsedate (4)
parsnip (17)
partitions (1)
party (57)
partykit (4)
pasilla (996)
pasillaBamSubset (330)
PasillaTranscriptExpr (54)
pastecs (1)
PASWR (1)
patch (1)
patchwork (78)
pathfindR (1)
pathfindR.data (1)
pathifier (0)
PathNetData (43)
pathprintGEOData (4)
pathview (1)
pathways (1)
PatientProfiles (1)
patientProfilesVis (1)
patrick (1)
paws (15)
paws.analytics (15)
paws.application.integration (15)
paws.common (110)
paws.compute (65)
paws.cost.management (15)
paws.customer.engagement (15)
paws.database (16)
paws.developer.tools (15)
paws.end.user.computing (15)
paws.machine.learning (15)
paws.management (15)
paws.networking (15)
paws.security.identity (15)
paws.storage (106)
pbapply (40)
pbdZMQ (2)
PBIR (0)
pbivnorm (1)
pbkrest (0)
pbkrtest (53)
pbmcapply (1)
pbmcref.SeuratData (1)
PBSddesolve (1)
PBSmapping (1)
pbv (1)
pcaExplorer (0)
pcaGoPromoter.Hs.hg19 (13)
pcaGoPromoter.Mm.mm9 (12)
pcaGoPromoter.Rn.rn4 (12)
pcalg (1)
pcaMethods (1)
PCAmixdata (1)
pcaPP (20)
PCAtools (1)
PCDimension (1)
pch (1)
PCHiCdata (61)
PCICt (1)
pcse (1)
pcxnData (60)
pd.atdschip.tiling (36)
pdfCluster (1)
pdftools (9)
pdInfoBuilder (1)
pdist (1)
pdp (1)
PeacoQC (1)
PeakcoQC (1)
pec (1)
pedigree (0)
pedigreemm (1)
pedtools (1)
pegas (2)
pegboard (0)
PEIP (1)
PEMM (1)
penalized (1)
pepDat (44)
PepsNMRData (47)
Peptides (1)
performance (12)
PerformanceAnalytics (1)
periscope (1)
perm (9)
permimp (1)
permute (4)
PFAM.db (1)
PFIM (1)
pgirmess (1)
PGPC (4)
PGSEA (0)
phangorn (3)
pharmaRTF (1)
pharmaversesdtm (1)
phastCons100way.UCSC.hg19 (2)
pheatmap (1)
phenoTest (1)
philentropy (2)
phonTools (1)
phosphoricons (7)
PhosR (0)
phyclust (1)
phylobase (1)
phylocanvas (0)
phylogram (0)
phylolm (1)
PhyloProfileData (22)
phyloseq (1)
phylosignal (1)
phylotools (0)
phyr (1)
phytools (7)
picante (1)
piggyback (1)
pillar (86)
pimeta (1)
pinfsc50 (1)
pingr (13)
pins (21)
pipebind (1)
pipeR (1)
piton (1)
pivotalPilars (1)
pivotalPillars (1)
pivotalReporters (1)
pixmap (11)
PK (1)
pkbrtest (1)
pkgbuild (146)
pkgcache (10)
pkgconfig (3)
pkgdepends (11)
pkgdown (105)
pkgKitten (1)
pkglite (1)
pkgload (317)
pkgmaker (2)
pkgpub (1)
pkgsearch (1)
PKI (5)
PKNCA (1)
PKPDdatasets (1)
PKPDmodels (1)
PKreport (1)
planet (1)
plantecophys (1)
plasFIA (7)
plier (0)
plm (1)
PLNmodels (1)
plogr (2)
plot3D (4)
plot3Drgl (1)
plotfunctions (1)
plotgardener (0)
plotgardenerData (86)
plotly (150)
plotlyGeoAssets (1)
plotmm (0)
plotmo (2)
plotrix (16)
plotROC (2)
pls (4)
plumber (20)
plyr (169)
plyranges (1)
PMA (1)
pmartR (1)
PMCMRplus (2)
pmforest (1)
pmml (1)
pmparams (1)
pmplots (1)
pmtables (1)
pmxTools (1)
png (51)
poeticST (1)
poibin (1)
poilog (1)
pointblank (1)
PoissonBinomial (0)
polars (1)
poLCA (1)
polspline (4)
Polychrome (0)
polyclip (99)
polycor (1)
polyCub (3)
polyester (0)
polynom (5)
PolynomF (1)
polysat (0)
pool (10)
poolfstat (1)
poorman (2)
PopED (1)
poppr (1)
PossibilityCurves (2)
posterior (13)
PowerExplorer (1)
poweRlaw (10)
powerTCR (1)
PowerTOST (1)
powsimR (1)
ppcor (1)
ppiData (16)
prabclus (3)
pracma (32)
prada (1)
praise (1)
preAnomalyDetectionCredLife (1)
prebsdata (59)
PreciseSums (1)
preciseTADhub (20)
precommit (1)
precrec (1)
PREDAsampledata (62)
prediction (2)
predint (1)
PReMiuM (0)
preproc.iquizoo (1)
preprocessCore (1)
preprocessorCore (1)
preseqR (1)
presser (1)
presto (1)
prettycode (1)
prettydoc (1)
prettymapr (1)
prettyunits (193)
priceR (1)
primeviewcdf (1)
primeviewprobe (1)
princurve (1)
printr (1)
prioritylasso (1)
prismatic (6)
PRISMselector (1)
probably (1)
pROC (50)
processCore (0)
processx (304)
procs (1)
ProData (34)
prodlim (46)
productplots (1)
proffer (1)
profile (0)
profileModel (1)
profmem (1)
profvis (29)
progeny (1)
ProgMan (1)
progress (122)
progressr (49)
proj (0)
PROJ (5)
proj4 (19)
ProjecTILs (0)
projpred (1)
pRolocdata (239)
promise (1)
promises (259)
prompt (1)
prompter (2)
PropCIs (1)
properties (1)
propr (1)
PROreg (1)
PROscorer (1)
PROscorerTools (1)
ProSpect (1)
prostateCancerCamcap (29)
prostateCancerGrasso (33)
prostateCancerStockholm (22)
prostateCancerTaylor (25)
prostateCancerVarambally (23)
proteomixr (1)
ProtGenerics (1)
proto (1)
protoarrayr (1)
protolite (1)
protr (11)
protti (1)
protViz (1)
proxy (3)
proxyC (3)
PRROC (6)
pryr (13)
ps (310)
PSCBS (7)
pscl (3)
PsNR (1)
pspearman (1)
pspline (2)
psych (119)
psychometric (6)
psychotools (1)
psychotree (1)
psychTools (1)
ptairData (57)
PtH2O2lipids (82)
ptw (1)
PubChemR (1)
Publish (1)
PullReadAnalysisData (1)
pulsar (1)
pumadata (60)
PupillometryR (1)
PureCN (0)
purrr (150)
purrrlyr (1)
purrrr (1)
pvca (0)
pvclust (1)
PWMEnrich.Dmelanogaster.background (46)
PWMEnrich.Hsapiens.background (49)
PWMEnrich.Mmusculus.background (41)
pwr (1)
pwrEWAS.data (20)
PwrGSD (1)
pyinit (1)
pzfx (1)

Q

qap (14)
qbaDatabase (1)
qcc (1)
qclMatrix (1)
qcNvs (0)
qdapRegex (1)
qdapTools (1)
QDNAseq (1)
QDNAseq.hg19 (143)
QDNAseq.mm10 (74)
qgam (1)
QGEDP (1)
QGIOP (1)
QGMI (1)
QGplots (1)
QGqtl (1)
qgraph (2)
QGTAP (1)
QGtemplates (1)
qicharts (1)
qlcMatrix (18)
qpcR (0)
qpdf (3)
qPLEXdata (45)
qqconf (10)
qqman (3)
qqplotr (1)
qrcode (1)
qreport (1)
qrng (1)
qrnn (1)
qs (12)
QSARdata (1)
qtl (1)
qtl2 (2)
quadprog (2)
qualityTools (1)
qualpalr (1)
qualV (1)
quantable (1)
quanteda (1)
quantmod (13)
QuantPsyc (1)
quantreg (85)
quantsmooth (1)
quarto (10)
QUBICdata (42)
qubiGenestack (1)
questionr (2)
QuickJSR (5)
qvalue (1)
qvcalc (1)
qwraps2 (1)

R

r (1)
r-library-rags-stash (1)
R.cache (3)
R.devices (8)
R.filesets (8)
R.huge (7)
R.matlab (1)
R.methodsS3 (11)
R.oo (62)
R.rsp (1)
R.utils (117)
R2admb (1)
r2d2 (1)
r2d3 (2)
R2GUESS (1)
R2HTML (1)
R2jags (1)
R2OpenBUGS (1)
r2rtf (1)
R2wd (1)
R2WinBUGS (1)
R6 (33)
rAccess (1)
radarchart (1)
radiant (1)
radiant.data (1)
radiant.model (1)
radiator (0)
raerdata (39)
ragg (231)
rainbow (11)
rAmCharts (2)
RamiGO (0)
randomcoloR (6)
RandomFields (1)
RandomFieldsUtils (1)
randomForest (4)
randomForestSRC (2)
randomizr (1)
randomNames (1)
randtests (1)
randtoolbox (1)
rangeModelMetadata (1)
ranger (16)
RankAggreg (1)
RankProd (0)
RANN (3)
rapiclient (1)
RApiDatetime (1)
rapidjsonr (1)
rapidoc (1)
RApiSerialize (9)
rappdirs (8)
rapportools (2)
rARPACK (6)
raster (23)
rasterVis (1)
ratelimitr (1)
RAthena (12)
rayimage (1)
rayrender (1)
rayvertex (1)
rbenchmark (1)
RBesT (1)
RBGL (1)
rbibutils (48)
rbioapi (4)
RBioFormats (1)
rBLAST (1)
rbmi (1)
rbokeh (1)
Rcapture (1)
rcartocolor (1)
RccpTOML (1)
rcdk (11)
rcdklibs (12)
rcellminerData (80)
Rcgmin (1)
rCharts (1)
Rchoice (1)
RCircos (0)
RcisTarget (1)
RcisTarget.hg19.motifDBs.cisbpOnly.500bp (119)
RClickhouse (1)
rclipboard (7)
rcmdcheck (16)
Rcmdr (1)
RcmdrMisc (2)
RColorBrewer (21)
rcompanion (1)
rcorpora (1)
Rcpp (341)
rcpp (1)
RcppAlgos (1)
RcppAnnoy (46)
RcppArmadillo (254)
RcppCCTZ (1)
RcppClassic (0)
RcppDate (1)
RcppDE (1)
RcppDist (1)
RcppEigen (181)
RcppEnsmallen (1)
RcppGSL (5)
RcppHNSW (33)
RcppInt64 (1)
RcppML (7)
RcppNumerical (2)
RcppParallel (23)
RcppProgress (1)
RcppRoll (5)
RcppSimdJson (34)
RcppSpdlog (1)
RcppThread (3)
RcppTOML (20)
RcppZiggurat (7)
Rcsdp (1)
RCurl (211)
RCy3 (1)
Rd2roxygen (0)
RDAVIDWebService (0)
RDCOMClient (1)
rdd (1)
rdflib (1)
Rdimtools (1)
rdocx (1)
Rdpack (50)
rdrop2 (1)
Rdsdp (1)
reactable (3)
reactlog (1)
reactome.db (2)
ReactomeGSA (0)
ReactomeGSA.data (76)
ReactomePA (1)
reactR (29)
readbitmap (1)
reader (1)
readJDX (1)
readODS (2)
readr (130)
readstata13 (1)
readxl (79)
rearrr (1)
REBayes (1)
recipes (62)
reclin (1)
recommenderlab (2)
recosystem (2)
reda (1)
REddyProc (1)
RedeR (1)
redison (1)
redland (1)
redoc (1)
redux (1)
refinr (1)
RefManageR (1)
refund (1)
reghelper (1)
registry (2)
RegParallel (76)
regress (1)
relaimpo (1)
relations (1)
reldist (9)
relimp (1)
relsurv (1)
remaCor (7)
rematch (100)
rematch2 (2)
remotes (154)
renderthis (1)
rentrez (2)
renv (152)
Repitools (1)
report (2)
reporter (1)
ReporteRs (1)
ReporteRsjars (1)
reporting (1)
ReportingTools (1)
repr (6)
reprex (72)
repurrrsive (1)
reReg (1)
reshape (5)
reshape2 (8)
ResidualMatrix (1)
ResourceSelection (1)
restfulr (12)
restfulSEData (98)
RestRserve (1)
reticulate (85)
revealgenomics (1)
RevGadgets (1)
review (1)
rex (15)
Rfast (18)
Rfast2 (2)
rfcdmin (6)
Rfit (1)
RFOC (8)
RforProteomics (138)
rgbif (1)
RGCCA (0)
rgdal (21)
rgenoud (1)
rgeos (18)
rgexf (1)
rgl (4)
Rglpk (1)
rglwidget (1)
RGMQLlib (54)
rgnparser (1)
RgoogleMaps (7)
rgr (1)
Rgraphviz (1)
rGREAT (1)
rhandsontable (3)
rhdf5 (3)
rhdf5filters (2)
Rhdf5lib (3)
rheumaticConditionWOLLBOLD (33)
rhino (10)
RhpcBLASctl (2)
Rhtslib (2)
rhub (3)
rice (1)
RICGA.clinical (1)
RIdeogram (0)
ridigbio (2)
riem (1)
Ringo (1)
rintrojs (7)
rio (15)
RIPSeeker (1)
RIPSeekerData (15)
RISCA (1)
riskmetric (1)
riskRegression (2)
RITANdata (65)
ritis (1)
RItools (1)
riverplot (1)
rj (1)
rj.gd (1)
rjags (1)
rJava (105)
RJDBC (1)
rjson (22)
rjsoncons (1)
RJSONIO (18)
Rlab (0)
Rlabkey (1)
rlang (466)
rlaR (1)
rlecuyer (1)
rlemon (1)
RLHub (22)
rliger (1)
rlist (1)
rlistings (2)
RLRsim (1)
rly (0)
Rmagic (1)
rmapshaper (1)
RMariaDB (18)
rmarkdown (370)
RMassBankData (57)
rmatio (1)
rmcorr (1)
rmdformats (1)
rmeta (1)
rminer (1)
rmint.sdtm (1)
rmio (1)
rMisbeta (1)
Rmisc (1)
Rmixmod (1)
Rmpfr (16)
Rmpi (1)
rms (4)
rmsb (1)
rmspc (1)
RMTstat (1)
rmutil (1)
rMVP (1)
RMySQL (5)
RNAi (1)
RNAinteractMAPK (33)
RNAmodR.Data (73)
RNAseqData.HeLa.bam.chr14 (3)
RNAseqData.HNRNPC.bam.chr14 (329)
RNASeqDataSubset (3)
rnaseqGene (1)
RNASeqPower (0)
RNAseqQC (1)
RNASeqRData (5)
RnaSeqSampleSizeData (107)
RnaSeqTutorial (14)
rnaturalearth (2)
rnaturalearthdata (1)
RnBeads (0)
RnBeads.hg19 (189)
RnBeads.hg38 (116)
RnBeads.mm10 (77)
rnbeads.mm10 (0)
RnBeads.mm9 (87)
RnBeads.rn5 (33)
rncl (1)
RNetCDF (3)
RNeXML (1)
rngtools (3)
rngWELL (1)
RNifti (1)
rnoaa (1)
RNOmni (1)
roak (1)
robfilter (2)
RobinCar (1)
RobStatTM (1)
robumeta (1)
robust (17)
robustbase (36)
robustlmm (1)
RobustRankAggreg (0)
ROC (1)
ROCit (1)
ROCR (2)
RODBC (4)
ROI (1)
ROI.plugin.glpk (1)
ROI.plugin.lpsolve (1)
roll (2)
rols (0)
Rook (1)
rootSolve (15)
ropls (1)
roptim (1)
ROracle (1)
ROSE (1)
rosettR (0)
rosm (1)
rotl (2)
round (1)
roxygen (1)
roxygen2 (165)
rpact (1)
rpart (71)
rpart.plot (1)
RPEGLMEN (1)
RPEIF (1)
RPESE (1)
rpf (1)
RPMG (9)
RPostgres (77)
RPostgreSQL (4)
RPresto (1)
rprintf (1)
rprojroot (173)
rpromis (1)
RProtoBuf (1)
RProtoBufLib (1)
rpsftm (1)
RPtests (1)
RPushbullet (1)
Rqc (0)
rr2 (1)
rrapply (1)
rrBLUP (1)
RRBSdata (36)
rrcov (22)
rrcovNA (1)
rRDPData (46)
rredlist (1)
RRPP (1)
rrsq (1)
rsample (25)
Rsamtools (4)
rsatscan (1)
rsbml (0)
RSclient (1)
rsconnect (49)
RSEIS (9)
RSelenium (2)
Rserve (1)
RSiena (1)
rslurm (1)
rsm (1)
Rsmlx (1)
Rsmlx.1 (0)
Rsmlx.2 (0)
RSNNS (0)
rsnps (1)
Rsolnp (2)
rsparkling (1)
rsparse (1)
RSpectra (36)
Rspectra (1)
rspm (1)
RSQLite (213)
RsSimulx (0)
RsSimulx.1 (0)
rstan (16)
rstanarm (1)
rstanemax (1)
rstantools (13)
rstatix (25)
rstpm2 (1)
rstudioapi (171)
Rsubread (1)
rsvd (11)
rsvg (3)
RSVSim (1)
Rsymphony (1)
rtables (5)
RTCGA.clinical (282)
RTCGA.CNV (63)
RTCGA.methylation (60)
RTCGA.miRNASeq (118)
RTCGA.mRNA (185)
RTCGA.mutations (87)
RTCGA.PANCAN12 (145)
RTCGA.rnaseq (133)
RTCGA.RPPA (56)
RTCGAToolbox (0)
rtdists (1)
rtf (1)
rticles (1)
rtkore (1)
RTN (1)
rtracklayer (3)
Rtsne (35)
Rttf2pt1 (3)
rtweet (7)
Ruchardet (0)
rugarch (3)
RUnit (11)
runjags (1)
runner (3)
runonce (0)
Runuran (1)
ruODK (1)
ruv (1)
RUVnormalizeData (72)
RUVseq (0)
RVAideMemoire (1)
Rvcg (1)
rvcheck (4)
RVenn (0)
RVerbalExpressions (1)
rversions (35)
rvertnet (1)
rvest (154)
rvg (1)
Rvmmin (2)
RVtests (0)
Rwave (7)
RWiener (1)
rworldmap (1)
RxODE (1)
rxode2 (1)
rxode2et (1)
rxode2ll (1)
rxode2parse (1)
rxode2random (1)
Ryacas (1)
rzmq (2)

S

s2 (49)
S4Arrays (2)
S4Vectors (12)
S4vectors (1)
saemix (1)
safeBinaryRegression (1)
safetyData (1)
safetyexploreR (1)
SAGx (1)
SAIGEgds (0)
sampleClassifierData (41)
sampleSelection (1)
sampling (1)
samr (6)
sandwich (14)
santoku (1)
sas7bdat (1)
sasLM (1)
SASmixed (1)
sass (319)
sassy (1)
SASxport (1)
satchel (1)
satellite (3)
satuRn (1)
SBGNview.data (219)
SC3 (1)
scaeData (12)
scagnostics (1)
ScaledMatrix (2)
scales (144)
scalreg (1)
scam (1)
scanMiR (1)
scanMiRData (57)
scATAC.Explorer (23)
SCATE (0)
SCATEData (67)
scater (1)
scatterD3 (2)
scattermore (19)
scatterpie (35)
scatterplot3d (18)
scClassify (0)
scclusteval (0)
sccore (1)
sccs (0)
scCustomize (2)
scda (1)
scda.2021 (1)
scda.2022 (1)
ScDblFinder (1)
scDblFinder (2)
scDC (0)
sceptre (1)
scGate (1)
schoolmath (1)
scHOT (0)
scico (1)
scidb (1)
Scillus (0)
scistreer (9)
scITD (1)
scJonas (1)
SCLCBam (37)
scLinear (0)
scMerge (1)
scMultiome (66)
scoringRules (1)
SCP (1)
scpdata (65)
scPipe (0)
scran (2)
scRepertoire (1)
scrime (6)
scRNAseq (1735)
scRNASeq.spatial (0)
scry (1)
scrypt (5)
scs (1)
scTHI.data (40)
SCtools (1)
sctransform (22)
sctrnasform (1)
scuttle (12)
scviewer (0)
sda (1)
sdmpredictors (1)
SDMTools (1)
sdpR (1)
sdtmchecks (1)
secretbase (4)
secrets (1)
see (3)
segmented (29)
selectr (1)
sem (1)
semEff (1)
semTools (1)
sen2r (0)
sendmailR (2)
sensemakr (1)
sensitivity (1)
sensobol (1)
seq2pathway (0)
seq2pathway.data (163)
SeqArray (0)
seqArray (1)
seqc (34)
seqCNA.annot (44)
seqinr (15)
seqLogo (1)
seqmagick (3)
seqminer (13)
sequenza (1)
SeqVarTools (0)
seriation (32)
SeruatObject (1)
serumStimulation (26)
servr (7)
sesame (1)
sesameData (943)
sessioninfo (17)
set (1)
set6 (1)
setRNG (2)
sets (1)
settings (1)
Seurat (61)
seurat (1)
SeuratData (1)
SeuratDisk (1)
SeuratObject (46)
SeuratWrapper (1)
SeuratWrappers (1)
seventyGeneData (45)
sf (45)
SFEData (105)
sfheaders (21)
sfsmisc (4)
sftime (1)
sgeostat (1)
SGP (1)
shadowtext (33)
shape (62)
shapefiles (1)
shapes (1)
shapr (0)
SHELF (1)
shinipsum (1)
shiny (316)
shiny.blueprint (2)
shiny.fluent (1)
shiny.react (4)
shiny.router (1)
shiny.semantic (1)
shinyAce (2)
shinyalert (14)
shinyauth (1)
shinyauthr (1)
shinyBS (10)
shinybusy (19)
shinycssloaders (4)
shinydashboard (4)
shinydashboardPlus (15)
shinydisconnect (3)
shinyEffects (1)
shinyEventLogger (1)
shinyfeedback (0)
shinyFeedback (1)
shinyFiles (14)
shinyglide (1)
shinyhelper (6)
ShinyItemAnalysis (10)
shinyjqui (1)
shinyjs (7)
shinyloadtest (1)
shinyLP (2)
shinymanager (3)
shinyMatrix (1)
shinyMethyl (0)
shinyMethylData (61)
shinyMobile (1)
shinypanel (7)
shinyscreenshot (4)
shinySelect (0)
shinystan (1)
shinytest (2)
shinytest2 (17)
shinythemes (2)
shinytoastr (1)
shinyTree (3)
Shinyusagelogr (1)
shinyvalidate (55)
shinyWidgets (120)
ShortRead (1)
showimage (1)
showtext (3)
showtextdb (1)
SIAMCAT (1)
SID (1)
sigaR (0)
sigclust (1)
Sigfried (1)
siggenes (1)
Signac (14)
signac (1)
signal (1)
signatureSearchData (203)
sigPathway (0)
silver3 (1)
SimBenchData (25)
SimComp (1)
SimDesign (1)
simex (1)
SimInf (1)
simmer (1)
SimMultiCorrData (1)
simpar (1)
simpIntLists (92)
simpleaffy (0)
simplermarkdown (1)
simplifyEnrichment (0)
simputation (1)
simr (1)
simresults (1)
simsurv (1)
simul (1)
Single.mTEC.Transcriptomes (28)
SingleCellExperiment (12)
SingleCelLExperiment (0)
SingleCellMultiModal (92)
singleCellTK (0)
SingleMoleculeFootprintingData (43)
SingleR (1)
singscore (0)
sirnakit (1)
SIS (1)
siscreener (1)
sitmo (9)
sjlabelled (1)
sjmisc (1)
sjPlot (2)
sjstats (1)
SKAT (12)
SkewHyperbolic (2)
skewt (1)
skimr (1)
skmeans (1)
slackr (1)
slam (7)
slickR (0)
slider (18)
slingshot (1)
sloop (1)
slopeR (1)
sm (1)
smacof (1)
SmartEDA (1)
smcfcs (1)
sme (1)
smfishHmrf (1)
smldesign (1)
smokingMouse (37)
smooth (1)
smoother (1)
smoothHR (0)
smotefamily (1)
SMVar (8)
sn (14)
sna (2)
SNAData (33)
SNAGEEdata (65)
snakecase (26)
SnapATAC (0)
snapcount (1)
snow (18)
SnowballC (5)
snowfall (2)
snpar (1)
SNPhoodData (43)
SNPlocs.Hsapiens.dbSNP151.GRCh38 (0)
SNPRelate (1)
snpStats (1)
sodium (12)
softImpute (1)
soilDB (1)
solrium (1)
solvebio (1)
som (1)
SomaDataIO (2)
SomatiCAData (26)
SomaticCancerAlterations (80)
SomaticSignatures (1)
SomaVarDB (0)
SOMbrero (1)
sommer (1)
sortable (7)
sos (1)
SoupX (1)
sourcetools (48)
sp (108)
spacefillr (1)
spacetime (2)
spacexr (1)
spacrt (1)
spade (0)
spam (6)
spam64 (1)
spaMM (1)
sparkline (1)
sparklyr (13)
SPARQL (1)
SparseArray (1)
sparsebn (1)
sparsebnUtils (1)
SparseGrid (1)
SparseM (47)
sparseMatrixStats (2)
sparsepca (1)
sparsesvd (20)
spatial (43)
SpatialCPie (0)
SpatialDatasets (21)
SpatialDecon (1)
spatialDmelxsim (19)
SpatialEpi (1)
SpatialExperiment (1)
spatialLIBD (277)
spatialreg (1)
SpATS (1)
spatstat (5)
spatstat.core (14)
spatstat.data (33)
spatstat.explore (40)
spatstat.geom (47)
spatstat.linnet (5)
spatstat.model (5)
spatstat.random (44)
spatstat.sparse (28)
spatstat.univar (1)
spatstat.utils (33)
spatsurv (1)
spd (1)
spData (15)
spdata (1)
spdep (8)
spec (1)
spectacles (1)
speedglm (1)
SPEI (1)
spelling (3)
spgs (1)
SPIA (0)
SpidermiR (0)
SpikeIn (69)
SpikeInSubset (120)
splancs (10)
splatter (0)
spliceR (0)
SplicingVizUtils (1)
splines2 (1)
splitstackshape (1)
splitTools (1)
spls (1)
splus2R (4)
spocc (1)
SPOTlight (1)
spqnData (36)
spsComps (0)
sqldf (1)
SqlRender (1)
SQUAREM (2)
ssanv (1)
SSDM (1)
ssh (1)
SSPA (0)
stable (1)
stabledist (1)
stabs (1)
StanHeaders (18)
stargazer (1)
stars (9)
starter (1)
startup (5)
startupmsg (1)
StatCharrms (1)
statgenGWAS (1)
statgenGxE (1)
statgenHTP (1)
statgenIBD (1)
statgenMPP (1)
statgenSTA (1)
statip (1)
statmod (6)
statnet (0)
statnet.common (2)
statsExpressions (3)
statTarget (0)
STdeconvolve (0)
stdmchecks (1)
stdReg (1)
stemHypoxia (75)
stevedore (1)
STexampleData (275)
sticky (0)
stinepack (4)
stjudem (36)
stopwords (1)
storr (1)
strandannotate (1)
strawr (1)
strex (2)
string (1)
stringdist (23)
stringfish (11)
stringi (376)
stringr (225)
striprtf (1)
strucchange (1)
structToolbox (1)
stxBrain.SeuratData (1)
styler (72)
SubcellularSpatialData (18)
subplex (1)
subselect (1)
SummarizedExperiment (4)
summarytools (1)
sunburstR (0)
superheat (0)
SuperLearner (1)
superpc (1)
SuppDists (1)
supraHex (0)
survcomp (1)
surveillance (3)
survex (1)
survey (5)
survival (226)
survivalROC (1)
survminer (3)
survMisc (2)
survMS (1)
survPen (1)
survPresmooth (1)
survtmle (1)
susieR (20)
sva (1)
svd (1)
svDialogs (1)
svglite (37)
svGUI (1)
SVM2CRMdata (30)
svMisc (1)
svUnit (1)
swagger (1)
swamp (1)
Swiffer (1)
swirl (1)
sybil (1)
sybilGUROBI (1)
sybilSBML (1)
sylly (1)
sylly.en (1)
symengine (1)
symphony (1)
synapser (1)
synapterdata (97)
synbreed (1)
syntenet (0)
Synth (1)
sys (125)
sysfonts (2)
systemfit (1)
systemfonts (303)
systemPipeRdata (212)
syuzhet (1)

T

table1 (2)
tableHTML (1)
tableone (1)
tables (2)
TabulaMurisData (63)
TabulaMurisSenisData (76)
tabulizer (1)
tabulizerjars (1)
TailRank (5)
tanggle (0)
tarchetypes (9)
targets (11)
TargetScoreData (49)
TargetSearchData (57)
tartare (77)
taskscheduleR (1)
TauStar (1)
taxize (1)
taxonomizr (1)
TBX20BamSubset (90)
TCC (4)
TCGAbiolinks (0)
TCGAbiolinksGUI.data (3544)
TCGAbiolinksGul.data (1)
TCGAcrcmiRNA (24)
TCGAcrcmRNA (31)
TCGAMethylation450k (67)
tcgaWGBSData.hg19 (4)
TCGAWorkflowData (100)
tcltk2 (1)
tclust (1)
TeachingDemos (2)
teal (1)
teal.builder.modules (1)
teal.code (1)
teal.data (2)
teal.goshawk (1)
teal.logger (1)
teal.modules.clinical (1)
teal.modules.general (1)
teal.modules.sanofi (1)
teal.osprey (1)
teal.reporter (1)
teal.slice (2)
teal.transform (1)
teal.widgets (1)
templater (1)
tensor (1)
tensorA (11)
tensorflow (20)
TENxBrainData (107)
TENxBUSData (47)
TENxPBMCData (713)
TENxVisiumData (83)
TENxXeniumData (10)
tergm (0)
tern (2)
tern.gee (2)
tern.mmrm (1)
tern.rbmi (1)
terra (43)
tesseract (1)
tester (1)
testit (1)
testthat (311)
texreg (2)
text2vec (1)
textfeatures (1)
textrecipes (1)
textshape (1)
textshaping (180)
tfautograph (1)
TFBSTools (1)
tfdatasets (1)
TFisher (1)
TFMPvalue (9)
tfrmt (1)
tfruns (16)
tfse (1)
tgp (1)
TH.data (101)
thematic (6)
themeSanofi (1)
themis (1)
this.path (1)
threejs (1)
ThresholdROC (1)
tibbke (1)
tibble (85)
tictoc (10)
tidybayes (1)
tidycensus (19)
tidyclust (1)
tidycmprsk (1)
tidydr (1)
tidyfst (1)
tidygraph (43)
tidyHeatmap (1)
tidylog (1)
tidymodels (16)
tidyposterior (1)
tidypredict (1)
tidyproject (1)
tidyproteomics (1)
tidyquant (1)
tidyr (241)
tidyrules (1)
tidyselect (217)
tidySEM (1)
tidyseurat (1)
tidySummarizedExperiment (1)
tidytable (1)
tidyterra (2)
tidytext (5)
tidytlg (0)
tidytree (58)
tidyTree (1)
tidyverse (23)
tidyvpc (1)
tidyxl (2)
tiff (4)
tigris (21)
tikzDevice (1)
tiledb (1)
tiledbsoma (1)
timechange (169)
timecoursedata (191)
timeDate (41)
TimeProjection (1)
timereg (1)
TimerQuant (23)
timeSeries (9)
timetk (3)
tinesath1cdf (35)
tinesath1probe (31)
tinkr (0)
tinysnapshot (1)
tinytable (1)
tinytest (1)
tinytex (389)
tippy (1)
tis (1)
tissueTreg (52)
TitanCNA (0)
titanic (1)
tkrplot (1)
tkWidgets (1)
tldrm (1)
TLMoments (1)
tm (5)
tmap (1)
TMB (37)
tmcn (1)
TMExplorer (33)
tmle (2)
tmvnsim (1)
tmvtnorm (2)
TNO (1)
TNRS (1)
TOAST (1)
toastui (1)
tofsimsData (22)
tokenizers (4)
tokupika (1)
tolerance (1)
toOrdinal (1)
topdownrdata (46)
topGO (1)
topicmodels (1)
topr (2)
torch (1)
tornado (1)
Tplyr (2)
tracee (1)
trackViewer (1)
tradeSeq (1)
traits (1)
TrajectoryUtils (1)
tram (1)
transformGamPoi (1)
transformr (1)
TransOmicsData (8)
transport (1)
tree (1)
treeio (11)
treemap (2)
treemapify (1)
treespace (1)
TreeSummarizedExperiment (0)
trendeval (1)
triangle (1)
triebeard (5)
trimcluster (0)
tripack (1)
trtf (1)
truncdist (1)
truncnorm (6)
truncreg (1)
tryCatchLog (1)
TSCAN (0)
tseries (9)
tsfeatures (3)
tsibble (1)
tsibbledata (1)
tsModel (1)
tsne (2)
tsoutliers (1)
TSP (23)
TSSi (0)
tsvio (1)
ttdo (0)
TTR (6)
ttservice (1)
tuberculosis (21)
tufte (1)
TumourMethData (30)
tune (16)
tuneRanger (1)
Turnover.cells.pSILAC.TMT (1)
twang (1)
twangContinuous (1)
tweeDEseqCountData (196)
tweedie (1)
tweenr (39)
twilight (1)
twosamples (1)
TxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGene (1)
TxDb.Hsapiens.UCSC.hg38.knownGene (1)
txdbmaker (1)
tximeta (1)
tximport (1)
tximportDat (1)
tximportData (815)
txtq (1)
tzdb (67)

U

uatools (0)
UCell (1)
uchardet (1)
ucminf (5)
UCSC.utils (1)
udunits2 (1)
ufs (1)
umap (15)
Unicode (1)
unigd (1)
UniprotR (1)
unitizer (1)
units (51)
unix (1)
unmarked (1)
unrtf (1)
UpSetR (1)
urca (7)
urlchecker (1)
urltools (1)
usdm (1)
useful (1)
usethis (161)
usmap (1)
usmapdata (1)
utf8 (247)
utilsRmd (1)
utilsStuff (1)
uuid (231)
uwot (104)

V

V8 (41)
validate (1)
valr (1)
VAM (1)
vaplot (1)
variables (1)
variancePartition (1)
VariantAnnotation (1)
VariantToolsData (26)
VariantWarehouseBMS (1)
varImp (1)
vars (1)
vaultr (1)
VBsparsePCA (1)
vcd (4)
vcdExtra (1)
vcfR (2)
vcr (1)
vctrs (288)
vdbR (0)
vdiffr (3)
VectraPolarisData (27)
vegan (18)
vegawidget (1)
vembedr (1)
vendormetadatahelpers (1)
venn (10)
VennDiagram (2)
venneuler (0)
VGAM (17)
VGAMextra (1)
vhydeg (0)
VIM (1)
vimp (1)
VineCopula (1)
vioplot (1)
vip (1)
viper (1)
vipor (19)
viridis (214)
viridisLite (99)
viridislite (0)
visdat (1)
visNetwork (6)
visR (1)
vistime (31)
vitae (1)
vpc (1)
vroom (166)
vscDebugger (1)
vsn (1)
vulcandata (60)

W

WA43966.shareR.3043877 (1)
waffle (1)
waiter (12)
wakefield (1)
waldo (166)
wallace (1)
warp (16)
wateRmelon (1)
waveslim (1)
waveTilingData (12)
wdm (1)
wdman (2)
weaver (0)
webchem (1)
webdriver (1)
WeberDivechaLCdata (47)
webfakes (1)
WebGestaltR (1)
webmockr (1)
webp (1)
webshot (36)
webshot2 (3)
websocket (5)
webutils (2)
WeightIt (2)
weights (3)
WES.1KG.WUGSC (53)
wesanderson (1)
WGCNA (14)
WGScan (0)
WGSmapp (52)
wheatmap (1)
whereami (0)
whisker (48)
whitening (1)
whoami (1)
WibiR (1)
widgetTools (1)
WikidataQueryServiceR (1)
WikidataR (1)
WikipediR (4)
wikitaxa (1)
wildmeta (1)
winboxr (1)
withr (315)
wk (52)
wkb (1)
wordcloud (1)
wordcloud2 (1)
workflowr (1)
workflows (14)
workflowsets (15)
WorldFlora (1)
worrms (2)
wrapr (1)
Wrench (1)
writexl (24)
WriteXLS (4)
wrMisc (1)
WRS2 (2)

X

xairadiffex (1)
xaringan (1)
xaringanExtra (1)
xaringanthemer (1)
xbioc (0)
xcms (1)
xcoredata (35)
xfun (442)
xgboost (108)
xgxr (1)
XhybCasneuf (31)
XIFF (1)
XLConnect (1)
XLConnectJars (1)
xlsx (1)
xlsxjars (1)
XML (158)
xml2 (186)
xmlparsedata (1)
xopen (25)
xportr (1)
xpose (1)
xpose.nlmixr2 (1)
xpose4 (1)
xrf (1)
xslt (3)
xtable (3)
xts (30)
XVector (2)

Y

yaImpute (2)
yaml (246)
YAPSA (1)
yardstick (23)
yeastCC (107)
yeastExpData (182)
yeastGSData (26)
yeastNagalakshmi (82)
yeastRNASeq (86)
ymlthis (0)
yri1kgv (11)
yriMulti (6)
yspec (1)
yulab.utils (69)

Z

zCompositions (11)
zeallot (1)
zebrafishRNASeq (213)
zellkonverter (1)
zelusutils (1)
zen4R (1)
zenith (1)
zinbwave (1)
zip (197)
Ziploc (1)
zlibbioc (4)
zoo (36)