### R code from vignette source 'vignette.Rnw' ################################################### ### code chunk number 1: vignette.Rnw:144-148 ################################################### x <- c(0, 19, 38, 57, 76, 95, 114, 133, 152, 170, 190, 208, 227, 246, 265, 284, 303, 322, 341, 360) y <- c(0.9, 1, 1.2, 1, 2, 4, 7, 3, 4, 2, 1.1, 1, 1, 1, 0.9, 1.2, 1, 0.8, 1.1, 1) ################################################### ### code chunk number 2: vignette.Rnw:153-154 ################################################### plot(x, y) ################################################### ### code chunk number 3: vignette.Rnw:167-169 ################################################### library("cardidates") res <- fitweibull6(x, y) ################################################### ### code chunk number 4: vignette.Rnw:177-178 ################################################### summary(res) ################################################### ### code chunk number 5: vignette.Rnw:199-200 ################################################### plot(res) ################################################### ### code chunk number 6: vignette.Rnw:225-226 ################################################### data(carditest) ################################################### ### code chunk number 7: vignette.Rnw:238-239 ################################################### tt <- metaCDW(carditest, xstart = 55) ################################################### ### code chunk number 8: vignette.Rnw:244-245 ################################################### summary(tt) ################################################### ### code chunk number 9: vignette.Rnw:256-257 ################################################### plot(as.numeric(carditest$sample) * 365 + carditest$x, carditest$y, type = "b") ################################################### ### code chunk number 10: vignette.Rnw:276-277 ################################################### print(plot(tt, carditest, layout=c(1, 3))) ################################################### ### code chunk number 11: vignette.Rnw:380-383 ################################################### set.seed(537) x <- seq(1, 360, length = 50) y <- exp(cos(x/20)) + 0.3 + rnorm(x, sd = 0.3) ################################################### ### code chunk number 12: vignette.Rnw:391-392 ################################################### peaks <- peakwindow(x, y, xstart = 60) ################################################### ### code chunk number 13: vignette.Rnw:399-400 ################################################### plot(peaks) ################################################### ### code chunk number 14: vignette.Rnw:422-425 ################################################### smd <- peaks$smd.indices res <- fitweibull6(x[smd], y[smd]) summary(res) ################################################### ### code chunk number 15: vignette.Rnw:428-430 ################################################### plot(res, ylim = c(0, 4), xlim = c(0, 360)) points(x, y, pch = "+", type = "b") ################################################### ### code chunk number 16: vignette.Rnw:453-454 ################################################### CDW(res, symmetric = FALSE) ################################################### ### code chunk number 17: vignette.Rnw:459-460 ################################################### CDW(res, quantile = 0.01, symmetric = FALSE)