############################################################################## ############################################################################## ### ### Running command: ### ### /home/biocbuild/R/R/bin/R CMD build --keep-empty-dirs --no-resave-data DegNorm ### ############################################################################## ############################################################################## * checking for file ‘DegNorm/DESCRIPTION’ ... OK * preparing ‘DegNorm’: * checking DESCRIPTION meta-information ... OK * cleaning src * installing the package to build vignettes * creating vignettes ... ERROR --- re-building ‘DegNorm.Rmd’ using rmarkdown Quitting from DegNorm.Rmd:266-268 [unnamed-chunk-17] ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ Error in `pm[[2]]`: ! subscript out of bounds --- Backtrace: ▆ 1. ├─DegNorm::plot_corr(DI = res_DegNorm_chr21$DI) 2. │ ├─heatmaply::heatmaply(...) 3. │ └─heatmaply:::heatmaply.default(...) 4. │ ├─heatmaply::heatmaply(...) 5. │ └─heatmaply:::heatmaply.heatmapr(...) 6. │ ├─... %>% layout(showlegend = FALSE) 7. │ ├─plotly::ggplotly(...) 8. │ └─plotly:::ggplotly.ggplot(...) 9. │ └─plotly::gg2list(...) 10. └─plotly::layout(., showlegend = FALSE) ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ Error: processing vignette 'DegNorm.Rmd' failed with diagnostics: subscript out of bounds --- failed re-building ‘DegNorm.Rmd’ SUMMARY: processing the following file failed: ‘DegNorm.Rmd’ Error: Vignette re-building failed. Execution halted