############################################################################## ############################################################################## ### ### Running command: ### ### /home/biocbuild/bbs-3.23-bioc/R/bin/R CMD build --keep-empty-dirs --no-resave-data rRDP ### ############################################################################## ############################################################################## * checking for file ‘rRDP/DESCRIPTION’ ... OK * preparing ‘rRDP’: * checking DESCRIPTION meta-information ... OK * installing the package (it is needed to build vignettes) * creating vignettes ... ERROR --- re-building ‘rRDP.Rmd’ using rmarkdown Quitting from rRDP.Rmd:108-111 [unnamed-chunk-8] ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ Error in `rdp()`: ! Install package 'rRDPData' for the trained 16S rRNA classifier. --- Backtrace: ▆ 1. ├─stats::predict(rdp(), seq) 2. └─rRDP::rdp() ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ Error: processing vignette 'rRDP.Rmd' failed with diagnostics: Install package 'rRDPData' for the trained 16S rRNA classifier. --- failed re-building ‘rRDP.Rmd’ SUMMARY: processing the following file failed: ‘rRDP.Rmd’ Error: Vignette re-building failed. Execution halted