############################################################################## ############################################################################## ### ### Running command: ### ### /Library/Frameworks/R.framework/Resources/bin/R CMD build --keep-empty-dirs --no-resave-data podkat ### ############################################################################## ############################################################################## * checking for file ‘podkat/DESCRIPTION’ ... OK * preparing ‘podkat’: * checking DESCRIPTION meta-information ... OK * cleaning src * installing the package (it is needed to build vignettes) * creating vignettes ... ERROR --- re-building ‘podkat.Rnw’ using knitr Quitting from podkat.Rnw:1530-1544 [UnmaskedRegionsSexHg38] ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ Error in `library()`: ! there is no package called 'GWASTools' --- Backtrace: x 1. \-base::library(GWASTools) ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ Error: processing vignette 'podkat.Rnw' failed with diagnostics: there is no package called 'GWASTools' --- failed re-building ‘podkat.Rnw’ SUMMARY: processing the following file failed: ‘podkat.Rnw’ Error: Vignette re-building failed. Execution halted