############################################################################## ############################################################################## ### ### Running command: ### ### /Library/Frameworks/R.framework/Resources/bin/R CMD build --keep-empty-dirs --no-resave-data DEWSeq ### ############################################################################## ############################################################################## * checking for file ‘DEWSeq/DESCRIPTION’ ... OK * preparing ‘DEWSeq’: * checking DESCRIPTION meta-information ... OK * installing the package (it is needed to build vignettes) * creating vignettes ... ERROR --- re-building ‘DEWSeq.Rmd’ using rmarkdown Quitting from DEWSeq.Rmd:604-614 [tmp significant windows] ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ Error: ! object 'ihw' not found --- Backtrace: ▆ 1. └─DESeq2::results(...) ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ Error: processing vignette 'DEWSeq.Rmd' failed with diagnostics: object 'ihw' not found --- failed re-building ‘DEWSeq.Rmd’ SUMMARY: processing the following file failed: ‘DEWSeq.Rmd’ Error: Vignette re-building failed. Execution halted