##############################################################################
##############################################################################
###
### Running command:
###
###   /home/biocbuild/R/R/bin/R CMD build --keep-empty-dirs --no-resave-data compSPOT
###
##############################################################################
##############################################################################


* checking for file ‘compSPOT/DESCRIPTION’ ... OK
* preparing ‘compSPOT’:
* checking DESCRIPTION meta-information ... OK
* installing the package to build vignettes
* creating vignettes ... ERROR
--- re-building ‘compSPOT-vignette.Rmd’ using rmarkdown

Quitting from compSPOT-vignette.Rmd:146-152 [sig.spots]
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
<error/rlang_error>
Error in `pm[[2]]`:
! subscript out of bounds
---
Backtrace:
    ▆
 1. └─compSPOT::find_hotspots(...)
 2.   └─compSPOT:::plot_sigspot(regions, ecdf_df)
 3.     ├─plotly::ggplotly(plot1, tooltip = c("text"))
 4.     └─plotly:::ggplotly.ggplot(plot1, tooltip = c("text"))
 5.       └─plotly::gg2list(...)
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~

Error: processing vignette 'compSPOT-vignette.Rmd' failed with diagnostics:
subscript out of bounds
--- failed re-building ‘compSPOT-vignette.Rmd’

SUMMARY: processing the following file failed:
  ‘compSPOT-vignette.Rmd’

Error: Vignette re-building failed.
Execution halted