############################################################################## ############################################################################## ### ### Running command: ### ### /home/biocbuild/R/R-4.3.1/bin/R CMD build --keep-empty-dirs --no-resave-data spatialDE ### ############################################################################## ############################################################################## * checking for file ‘spatialDE/DESCRIPTION’ ... OK * preparing ‘spatialDE’: * checking DESCRIPTION meta-information ... OK * installing the package to build vignettes * creating vignettes ... ERROR --- re-building ‘spatialDE.Rmd’ using rmarkdown WARNING: ignoring environment value of R_HOME Quitting from lines 123-125 [stabilize] (spatialDE.Rmd) Error: processing vignette 'spatialDE.Rmd' failed with diagnostics: one node produced an error: Package ‘reticulate’ version 1.34.0 cannot be unloaded: Error in unloadNamespace(package) : namespace ‘reticulate’ is imported by ‘basilisk’ so cannot be unloaded --- failed re-building ‘spatialDE.Rmd’ SUMMARY: processing the following file failed: ‘spatialDE.Rmd’ Error: Vignette re-building failed. Execution halted