############################################################################## ############################################################################## ### ### Running command: ### ### /home/biocbuild/R/R-4.3.1/bin/R CMD build --keep-empty-dirs --no-resave-data QuasR ### ############################################################################## ############################################################################## * checking for file ‘QuasR/DESCRIPTION’ ... OK * preparing ‘QuasR’: * checking DESCRIPTION meta-information ... OK * cleaning src * installing the package to build vignettes * creating vignettes ... ERROR --- re-building ‘QuasR.Rmd’ using rmarkdown Quitting from lines 902-910 [RNA_qAlign] (QuasR.Rmd) Error: processing vignette 'QuasR.Rmd' failed with diagnostics: The Rhisat2 package is required for alignments, but not installed. Install it using BiocManager::install("Rhisat2") --- failed re-building ‘QuasR.Rmd’ SUMMARY: processing the following file failed: ‘QuasR.Rmd’ Error: Vignette re-building failed. Execution halted