############################################################################## ############################################################################## ### ### Running command: ### ### chmod a+r RTCGAToolbox -R && F:\biocbuild\bbs-3.15-bioc\R\bin\R.exe CMD build --keep-empty-dirs --no-resave-data RTCGAToolbox ### ############################################################################## ############################################################################## * checking for file 'RTCGAToolbox/DESCRIPTION' ... OK * preparing 'RTCGAToolbox': * checking DESCRIPTION meta-information ... OK * installing the package to build vignettes * creating vignettes ... ERROR --- re-building 'RTCGAToolbox-vignette.Rmd' using rmarkdown Quitting from lines 131-134 (RTCGAToolbox-vignette.Rmd) Error: processing vignette 'RTCGAToolbox-vignette.Rmd' failed with diagnostics: failed to load external entity "http://gdac.broadinstitute.org/runs/stddata__2016_01_28/data/READ/20160128/" --- failed re-building 'RTCGAToolbox-vignette.Rmd' SUMMARY: processing the following file failed: 'RTCGAToolbox-vignette.Rmd' Error: Vignette re-building failed. Execution halted