################################################### ### chunk number 1: ################################################### library(RLMM) ################################################### ### chunk number 2: ################################################### x<-read.table("Xba.rlmm") x[1:2,1:5] ################################################### ### chunk number 3: ################################################### plot_theta(genotypefile="Xba.rlmm",thetafile="Xba.theta",plotfile="",snpsfile="snps.lst")